RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465576.1

CLRN1-AS1-201, CLRN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN1-AS1, Length 2,045 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LRCH1Q9Y2L9 728 aa5.83□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa5.83□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 A0A0G2JMM0 328 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 A0A1W2PPB8 328 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 A0A1W2PRS3 328 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KIR3DP1A8MWS1 328 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SHISA8B8ZZ34 492 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 BCKDKO14874 412 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NEURL1O76050 574 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SNX4O95219 450 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 WISP1O95388 367 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RPSAP08865 295 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FUT1P19526 365 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MSX1P28360 303 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RBM34P42696 430 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ARG2P78540 354 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TSPAN31Q12999 210 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TOMM20Q15388 145 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SLC36A3Q495N2 470 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TTC23Q5W5X9 447 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KRT80Q6KB66 452 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TMEM81Q6P7N7 255 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CCDC81Q6ZN84 652 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GRINAQ7Z429 371 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PLCZ1Q86YW0 608 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 C10orf53Q8N6V4 93 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PLPP7Q8NBV4 271 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 OR2M3Q8NG83 312 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 OR1J4Q8NGS1 313 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FRMD6Q96NE9 622 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF570Q96NI8 536 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MUS81Q96NY9 551 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NPAS1Q99742 590 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF426Q9BUY5 554 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HES7Q9BYE0 225 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ADAM19Q9H013 955 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MED17Q9NVC6 651 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IGF2RP11717 2491 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NCOR2Q9Y618 2525 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 OR5H15A6NDH6 313 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ENO4A6NNW6 628 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LRRN3E7EW58 273 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 H0YAE9 185 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CDC42EP2O14613 210 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RRP8O43159 456 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DENRO43583 198 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SUSD5O60279 629 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 OSMP13725 252 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PRKCAP17252 672 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MAKP20794 623 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GSTM3P21266 225 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CHMP24386 653 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FPR3P25089 353 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PLA2G5P39877 138 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SOX8P57073 446 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ESRRGP62508 458 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PRKCDQ05655 676 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 COX10Q12887 443 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FOXF1Q12946 379 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PDK3Q15120 406 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PLPPR5Q32ZL2 321 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TMEM236Q5W0B7 351 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TIGD3Q6B0B8 471 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LINC00114Q6XXX2 140 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SPACA3Q8IXA5 215 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PARP8Q8N3A8 854 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FADS6Q8N9I5 356 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 OR5M1Q8NGP8 315 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ST8SIA1Q92185 356 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GABARAPL3Q9BY60 117 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ANKRD60Q9BZ19 345 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GRIP2Q9C0E4 1043 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 EGLN3Q9H6Z9 239 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HHATLQ9HCP6 504 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DEPPQ9NTK1 212 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 REV1Q9UBZ9 1251 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IL20RAQ9UHF4 553 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ENOPH1Q9UHY7 261 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DKKL1Q9UK85 242 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TMEM5Q9Y2B1 443 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TMED7Q9Y3B3 224 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa5.82□□□□□ -1.48
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GMPPBQ9Y5P6 360 aa5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms