RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR11A1Q9GZK7 315 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC38A1Q9H2H9 487 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 LIPT1Q9Y234 373 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAP2CQ9Y3L5 183 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 WDR45Q9Y484 360 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 WNK2Q9Y3S1 2297 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 STAB1Q9NY15 2570 aa7.45□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 DYSFO75923 2080 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR5H1A6NKK0 313 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 E7EQL1 145 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 SULT2B1O00204 365 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 SDHDO14521 159 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 BIRC5O15392 142 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 CRLF1O75462 422 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYP7B1O75881 506 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 PMS2P2O95744 297 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGHV3-9P01782 118 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHRM4P08173 479 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 ITGA5P08648 1049 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 IMPDH2P12268 514 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 PGCP20142 388 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTNP21246 168 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 BGNP21810 368 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDKN2CP42773 168 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 MVDP53602 400 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC16A1P53985 500 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 IFFO1Q0D2I5 559 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAPQ12884 760 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 VEZF1Q14119 521 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 PDK3Q15120 406 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 PPA1Q15181 289 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 SYPL1Q16563 259 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 TIMM23BQ5SRD1 257 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 OGFOD2Q6N063 350 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 BHLHB9Q6PI77 547 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 C16orf62Q7Z3J2 963 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 GALNT5Q7Z7M9 940 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC103Q8IW40 242 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANKFN1Q8N957 763 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 XAGE5Q8WWM1 108 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 OIT3Q8WWZ8 545 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 INPP5KQ9BT40 448 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 NUF2Q9BZD4 464 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 DPY30Q9C005 99 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 MEAF6Q9HAF1 191 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 POLE3Q9NRF9 147 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC6A13Q9NSD5 602 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 PNPOQ9NVS9 261 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 MALT1Q9UDY8 824 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHRNA9Q9UGM1 479 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHST2Q9Y4C5 530 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC25A15Q9Y619 301 aa7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 V9GYY5 206 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1W2PP18 115 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1W2PR80 420 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM72A0PK05 275 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 E9PBE3 544 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 ABCD4O14678 606 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAD51DO75771 328 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 RYKP34925 604 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC1A6P48664 564 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPL14P50914 215 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 UFM1P61960 85 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCNJ10P78508 379 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 BST1Q10588 318 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 STK11Q15831 433 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 GABRA6Q16445 453 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRT71Q3SY84 523 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 COX20Q5RI15 118 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBXW9Q5XUX1 488 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 GRINAQ7Z429 371 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNF130Q86XS8 419 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRRC34Q8IZ02 419 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 WDR31Q8NA23 367 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR52E4Q8NGH9 312 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM234Q8WY98 164 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZBTB9Q96C00 473 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC115Q96NT0 180 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 MUS81Q96NY9 551 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC35A5Q9BS91 424 aa7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
GAPDHP28-201ENST00000455134 REG4Q9BYZ8 158 aa7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms