RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447261.6

BCRP3-201, Transcript of breakpoint cluster region pseudogene 3, humanhuman

TSL 2

Gene BCRP3, Length 1,457 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCRP3-201ENST00000447261 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa14.66□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 LSMEM1Q8N8F7 131 aa14.66□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 C17orf47Q8NEP4 570 aa14.66□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 APH1BQ8WW43 257 aa14.66□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 HS6ST2Q96MM7 605 aa14.66□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 TRIM2Q9C040 744 aa14.66□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 CTPS2Q9NRF8 586 aa14.66□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 ZNF226Q9NYT6 803 aa14.66□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 COPS7AQ9UBW8 275 aa14.66□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 TEKT2Q9UIF3 430 aa14.66□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa14.66□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 CEPT1Q9Y6K0 416 aa14.66□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 TEX15Q9BXT5 2789 aa14.66□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 CACNA1DQ01668 2161 aa14.65□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa14.65□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 PTGES3LE9PB15 166 aa14.65□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 NPIPA7E9PJI5 369 aa14.65□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 TO15178 435 aa14.65□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 LRRTM2O43300 516 aa14.65□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 FAM20BO75063 409 aa14.65□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 CLDN1O95832 211 aa14.65□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 TP53P04637 393 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 NPIPA8P0DM63 369 aa14.65□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 FPR3P25089 353 aa14.65□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 OMPP47874 163 aa14.65□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 C12orf73Q69YU5 71 aa14.65□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 FCRLBQ6BAA4 426 aa14.65□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 PLAG1Q6DJT9 500 aa14.65□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 SVOPQ8N4V2 548 aa14.65□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 ZNF527Q8NB42 609 aa14.65□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 ZNF540Q8NDQ6 660 aa14.65□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 ADIPOR1Q96A54 375 aa14.65□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 Q96MT0 163 aa14.65□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 TAAR6Q96RI8 345 aa14.65□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 SLX1AQ9BQ83 275 aa14.65□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 PRR14Q9BWN1 585 aa14.65□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 CXorf56Q9H5V9 222 aa14.65□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 UBQLN4Q9NRR5 601 aa14.65□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 RASSF1Q9NS23 344 aa14.65□□□□□ -0.06
BCRP3-201ENST00000447261 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 OR5H15A6NDH6 313 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 SERINC4A6NH21 518 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 A8MUA0 341 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 H3BN98 237 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 XPNPEP2O43895 674 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 OR6B1O95007 311 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 THY1P04216 161 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 POU1F1P28069 291 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 KRT20P35900 424 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 RFX3P48380 749 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 GIPRP48546 466 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 ST13P50502 369 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 HOXC5Q00444 222 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 CDK5Q00535 292 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 MVKQ03426 396 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 CNPY1Q3B7I2 92 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 CASP12Q6UXS9 341 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 PRSS48Q7RTY5 328 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 NKAIN4Q8IVV8 208 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 CLDN22Q8N7P3 220 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 OR8J1Q8NGP2 316 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 MYDGFQ969H8 173 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 UBE2FQ969M7 185 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 HSPBAP1Q96EW2 488 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 MPP4Q96JB8 637 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 PRSS27Q9BQR3 290 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 RNF32Q9H0A6 362 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 SLC25A19Q9HC21 320 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 SLC7A7Q9UM01 511 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 MYO7BQ6PIF6 2116 aa14.64□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 H3BSA7 217 aa14.63□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 KLF4O43474 513 aa14.63□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 RGS10O43665 173 aa14.63□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 HTR1AP08908 422 aa14.63□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 GKN3PP0CG01 181 aa14.63□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 PRG2P13727 222 aa14.63□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 HTR2AP28223 471 aa14.63□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 PMS2P3Q13401 168 aa14.63□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 EBPQ15125 230 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 INAQ16352 499 aa14.63□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 EXT1Q16394 746 aa14.63□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 KLHL26Q53HC5 615 aa14.63□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 ACER2Q5QJU3 275 aa14.63□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 TMEM201Q5SNT2 666 aa14.63□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 SLC25A30Q5SVS4 291 aa14.63□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 XAF1Q6GPH4 301 aa14.63□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 PTCHD4Q6ZW05 846 aa14.63□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 SLC29A4Q7RTT9 530 aa14.63□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 BEST3Q8N1M1 668 aa14.63□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 ZNF614Q8N883 585 aa14.63□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BCRP3-201ENST00000447261 TMIGD2Q96BF3 282 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms