RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 E9PI62 339 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 RFXAPO00287 272 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 SLC43A1O75387 559 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 IL1RNP18510 177 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 CD53P19397 219 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 GABRA5P31644 462 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 CLDN6P56747 220 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 SLC36A2Q495M3 483 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 C4orf17Q53FE4 359 aa6.26□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 OR52B6Q8NGF0 335 aa6.26□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 SLC41A2Q96JW4 573 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 METTL9Q9H1A3 318 aa6.26□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 MOKQ9UQ07 419 aa6.26□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 GKP32189 559 aa6.26□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 VASPP50552 380 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 PHYHIPQ92561 330 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 ELOVL3Q9HB03 270 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 LRRC30A6NM36 301 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 IDUAP35475 653 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 RPS5P46782 204 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 LTBQ06643 244 aa6.26□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 GALEQ14376 348 aa6.26□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 PDZD3Q86UT5 571 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 ABHD11Q8NFV4 315 aa6.26□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 C4orf36Q96KX1 117 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 CLEC3BP05452 202 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 PPT1P50897 306 aa6.26□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 ZNF595Q8IYB9 648 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 RNF175Q8N4F7 328 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 M1APQ8TC57 530 aa6.26□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 SULT1B1O43704 296 aa6.26□□□□□ -1.41
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USP46-201ENST00000441222 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 NETO1Q8TDF5 533 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 GAB3Q8WWW8 586 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 BRI3BPQ8WY22 251 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 PIGCQ92535 297 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 SLC6A18Q96N87 628 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 NOX3Q9HBY0 568 aa6.26□□□□□ -1.41
USP46-201ENST00000441222 EBF1Q9UH73 591 aa6.26□□□□□ -1.41
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