RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439476.6

BDNF-211, Transcript of brain derived neurotrophic factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BDNF, Length 4,532 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNF-211ENST00000439476 SLC2A1P11166 492 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 SYN1P17600 705 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 CRABP1P29762 137 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 RPS19P39019 145 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 CLRN1P58418 232 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 BLOC1S1P78537 153 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 PRKCZQ05513 592 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 SLAMF1Q13291 335 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 MELKQ14680 651 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 SLC5A12Q1EHB4 618 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 LY6G5CQ5SRR4 150 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 TMPRSS12Q86WS5 348 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 ZNF283Q8N7M2 679 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 CLRN3Q8NCR9 226 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 PHYHIPQ92561 330 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 RELTQ969Z4 430 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 C16orf58Q96GQ5 468 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 NPAS1Q99742 590 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 ATG5Q9H1Y0 275 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 NANSQ9NR45 359 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 ASIC5Q9NY37 505 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 COA4Q9NYJ1 87 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 CTSFQ9UBX1 484 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 PPT2Q9UMR5 302 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 MFSD2BA6NFX1 497 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 GJE1A6NN92 205 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 FTCDNL1E5RQL4 147 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 HPGDSO60760 199 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 CLEC3AO75596 197 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 RAB40ALP0C0E4 278 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 C8orf89P0DMQ9 161 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 SPNP16150 400 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 HOXA6P31267 233 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 PRSS3P35030 304 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 SLC19A1P41440 591 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 WDR5P61964 334 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 YIF1BQ5BJH7 314 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 ZMAT1Q5H9K5 638 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 CCNJQ5T5M9 372 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 OTOP2Q7RTS6 562 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 OR4M2Q8NGB6 313 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 OR4E2Q8NGC2 313 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 C2CD4CQ8TF44 421 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 ASB11Q8WXH4 323 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 RAB40AQ8WXH6 277 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 C11orf49Q9H6J7 331 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 PDE7BQ9NP56 450 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 SUSD2Q9UGT4 822 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 ADAM29Q9UKF5 820 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 GAB2Q9UQC2 676 aa5.96□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 CDHR4A6H8M9 788 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 H7BY64 318 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 M0R3H8 397 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 P2RX6O15547 441 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 LEFTY1O75610 366 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 EGFP01133 1207 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 INHBBP09529 407 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 C5AR1P21730 350 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 AK4P27144 223 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 APEX1P27695 318 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 GABRA3P34903 492 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 CAV3P56539 151 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 GGTA1PQ4G0N0 100 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 KCTD9Q7L273 389 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 P4HA3Q7Z4N8 544 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 MFSD8Q8NHS3 518 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 UBTD2Q8WUN7 234 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 AUTS2Q8WXX7 1259 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 BORCS8Q96FH0 119 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 KLHL15Q96M94 604 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 PRAP1Q96NZ9 151 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 OR2M2Q96R28 347 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 F2RL3Q96RI0 385 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa5.95□□□□□ -1.46
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BDNF-211ENST00000439476 CLEC4EQ9ULY5 219 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 EFCAB7A8K855 629 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 UPK1AO00322 258 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 KIAA0355O15063 1070 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 OIP5O43482 229 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 PRAMEF2O60811 474 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 SYNGR4O95473 234 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 CSN2P05814 226 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 SLC10A3P09131 477 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 SPARCP09486 303 aa5.95□□□□□ -1.46
BDNF-211ENST00000439476 ADRB3P13945 408 aa5.95□□□□□ -1.46
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