RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 LBPP18428 481 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 IL1RNP18510 177 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 TTKP33981 857 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 CDKN1AP38936 164 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 NUDT2P50583 147 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 PKNOX1P55347 436 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 MPP1Q00013 466 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 MS4A2Q01362 244 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 LCP2Q13094 533 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 SCGB2A2Q13296 93 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 TRIP10Q15642 601 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 PRTGQ2VWP7 1150 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 SYTL3Q4VX76 610 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 BEX5Q5H9J7 111 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 LCN8Q6JVE9 175 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 UGT3A1Q6NUS8 523 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 CYHR1Q6ZMK1 362 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa5.53□□□□□ -1.52
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PTPRK-211ENST00000429595 PYDC1Q8WXC3 89 aa5.53□□□□□ -1.52
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PTPRK-211ENST00000429595 ULK4Q96C45 1275 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 RCN3Q96D15 328 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 ATOH8Q96SQ7 321 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 PKP2Q99959 881 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 APOL2Q9BQE5 337 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 PIGQQ9BRB3 760 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 SLC39A3Q9BRY0 314 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 HAUS8Q9BT25 410 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 SFXN3Q9BWM7 321 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 BRINP2Q9C0B6 783 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 SACM1LQ9NTJ5 587 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 DNAJC11Q9NVH1 559 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 TAS2R13Q9NYV9 303 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 ZIM2Q9NZV7 527 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 ACTR3BQ9P1U1 418 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 SPRR3Q9UBC9 169 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 SCN2AQ99250 2005 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PP18 115 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 FEZF1A0PJY2 475 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 A8MXE2 369 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 MAGEB17A8MXT2 336 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 H3BMM5 538 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 FBP2O00757 339 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 RRHO14718 337 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 CLGNO14967 610 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 RGS10O43665 173 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 SRP72O76094 671 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 VENTXO95231 258 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 TFAP2AP05549 437 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTPRK-211ENST00000429595 FAM58BPP0C7Q3 252 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV4-31P0DP07 118 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 UROSP10746 265 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 PKMP14618 531 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 SLC25A16P16260 332 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 PEX2P28328 305 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 TACR3P29371 465 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 CMPK1P30085 196 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 PKLRP30613 574 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 TRPC1P48995 793 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 TTPAP49638 278 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 NUDT6P53370 316 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 AQP4P55087 323 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 STX1BP61266 288 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 PRAMEP78395 509 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 FAM27E3Q08E93 113 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTPRK-211ENST00000429595 APOFQ13790 326 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTPRK-211ENST00000429595 AFTPHQ6ULP2 937 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF793Q6ZN11 406 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 RTL4Q6ZR62 310 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 RNF44Q7L0R7 432 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 FUNDC1Q8IVP5 155 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 CCNYL1Q8N7R7 359 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 PLPP5Q8NEB5 264 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 OR9A4Q8NGU2 314 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 OR2L8Q8NGY9 312 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 NEIL3Q8TAT5 605 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 HMGCLL1Q8TB92 370 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 ANKRD49Q8WVL7 239 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRK-211ENST00000429595 LZICQ8WZA0 190 aa5.52□□□□□ -1.53
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