RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429174.6

DYSF-211, Transcript of dysferlin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene DYSF, Length 6,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSF-211ENST00000429174 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 A6NIZ1 184 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 NDUFA6P56556 154 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 RAP1BP61224 184 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 RAP1AP62834 184 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 TMEM201Q5SNT2 666 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 ACOT4Q8N9L9 421 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 OR13C2Q8NGS9 318 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 SLC25A31Q9H0C2 315 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 HEBP1Q9NRV9 189 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 EFCAB7A8K855 629 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 PVRP15151 417 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 C5AR1P21730 350 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 PRRC1Q96M27 445 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 C20orf24Q9BUV8 137 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 APBB3O95704 486 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 SERPINF1P36955 418 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 EMP2P54851 167 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 SYPL1Q16563 259 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.066e-6■■■□□ 18.7
DYSF-211ENST00000429174 FAM109AQ8N4B1 249 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 TMEM217Q8N7C4 229 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 BADQ92934 168 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 SGK3Q96BR1 496 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 CASP3P42574 277 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 BAXQ07812 192 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 MELKQ14680 651 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 OR5D18Q8NGL1 313 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 TUBB1Q9H4B7 451 aa14.66□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 PTGER4P35408 488 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 DUSP7Q16829 419 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 SLC19A3Q9BZV2 496 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 CAMK2AQ9UQM7 478 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 TNFRSF10AO00220 468 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 DNAJB6O75190 326 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 ITGAMP11215 1152 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 NTSR1P30989 418 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 TAS2R19P59542 299 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 RAB40BQ12829 278 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 TESK1Q15569 626 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 AADACL3Q5VUY0 350 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 CDRT4Q8N9R6 151 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 SORCS2Q96PQ0 1159 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 KLHL42Q9P2K6 505 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 MYOM1P52179 1685 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 ZP2Q05996 745 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 TCEAL1Q15170 157 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 CGB2Q6NT52 195 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 Q6ZSR6 202 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 ENTHD1Q8IYW4 607 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 BATF2Q8N1L9 274 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 SVBPQ8N300 66 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 HORMAD2Q8N7B1 307 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 GPR26Q8NDV2 337 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 C10orf71Q711Q0 1435 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 CACNA1FO60840 1977 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 GASTP01350 101 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 DSC1Q08554 894 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 PLA2G7Q13093 441 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 A6NHS1 94 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 LAMTOR5O43504 91 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 SLC10A3P09131 477 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 FCGR2AP12318 317 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 WDR5P61964 334 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 NRARPQ7Z6K4 114 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
DYSF-211ENST00000429174 A0A087WUU8 490 aa14.64□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 MSTNO14793 375 aa14.64□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 PMP2P02689 132 aa14.64□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 RABIFP47224 123 aa14.64□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 FXNQ16595 210 aa14.64□□□□□ -0.07
DYSF-211ENST00000429174 BRICD5Q6PL45 260 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms