RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 OR1F2PQ96R84 312 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 IL4I1Q96RQ9 567 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 STRADBQ9C0K7 418 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 SEMA3GQ9NS98 782 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF222Q9UK12 451 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 CORO2BQ9UQ03 480 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 LOXL2Q9Y4K0 774 aa18.74■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 DLL1O00548 723 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 CLDN4O14493 209 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 CTNSO60931 367 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 ATP1B1P05026 303 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 POU1F1P28069 291 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 PPP2R1BP30154 601 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM64Q6YI46 380 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 HSDL2Q6YN16 418 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 CFAP77Q6ZQR2 320 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 SZRD1Q7Z422 152 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 PIGUQ9H490 435 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 MCCC2Q9HCC0 563 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 DMXL1Q9Y485 3027 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 SH3D21A4FU49 640 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 IL1AP01583 271 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF28P17035 718 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 SDC2P34741 201 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 SOX18P35713 384 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 CAV3P56539 151 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 HSD17B7P56937 341 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 RPS26P62854 115 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 IL18Q14116 193 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 CLLU1Q5K131 121 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 CLVS2Q5SYC1 327 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 CNIH2Q6PI25 160 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 CLDN22Q8N7P3 220 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 NFKBIDQ8NI38 313 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 ELP4Q96EB1 424 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 MED28Q9H204 178 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 NDUFB11Q9NX14 153 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 CTSFQ9UBX1 484 aa18.73■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 PMS2P1A4D2B8 440 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 B4E171 279 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 NDUFA2O43678 99 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 CHP2O43745 196 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 LGI1O95970 557 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 MT-CO3P00414 261 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 HBQ1P09105 142 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 RRASP10301 218 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 ETV5P41161 510 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 TSPAN7P41732 249 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 GANABQ14697 944 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 SNAPC1Q16533 368 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 KLHL22Q53GT1 634 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 VWA2Q5GFL6 755 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 ADGRG3Q86Y34 549 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 GHDCQ8N2G8 530 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC17Q8N6Y2 441 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 SFXN5Q8TD22 340 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 DOK4Q8TEW6 326 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 ST8SIA4Q92187 359 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 ZFP64Q9NPA5 681 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 SLC39A1Q9NY26 324 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 RDH8Q9NYR8 311 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 TPST2O60704 377 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 ENTPD6O75354 484 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 IFNA7P01567 189 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 HLA-DQB1P01920 261 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 SSTR2P30874 369 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 RORAP35398 523 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF628Q5EBL2 1059 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 HES3Q5TGS1 186 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 MED25Q71SY5 747 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 C6orf120Q7Z4R8 191 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 OR7G2Q8NG99 324 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 OR11H4Q8NGC9 324 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 RHCGQ9UBD6 479 aa18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 SLC35E2P0CK97 266 aa18.71■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 EFNA3P52797 238 aa18.71■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 RAB14P61106 215 aa18.71■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 STX4Q12846 297 aa18.71■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 SCARB2Q14108 478 aa18.71■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 COL28A1Q2UY09 1125 aa18.71■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 RAB11FIP2Q7L804 512 aa18.71■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 LINC00518Q8N0U6 118 aa18.71■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 WACQ9BTA9 647 aa18.71■□□□□ 0.59
UBE2B-201ENST00000265339 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms