RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515753.1

HERC4-215, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 2

Gene HERC4, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HERC4-215	ENST00000515753	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	NUP58	Q9BVL2	599 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	TRIM9	Q9C026	710 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	COA1	Q9GZY4	146 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ALG9	Q9H6U8	611 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	KCNK13	Q9HB14	408 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	PRR34	Q9NV39	138 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	GALP	Q9UBC7	116 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	GNG12	Q9UBI6	72 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	EMCN	Q9ULC0	261 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	IFT52	Q9Y366	437 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	NEDD4	P46934	1319 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ZNF609	O15014	1411 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ESYT2	A0FGR8	921 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	HEATR9	A2RTY3	570 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ACOD1	A6NK06	481 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753		H3BMH7	237 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	PDLIM1	O00151	329 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	EI24	O14681	340 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	IMPA2	O14732	288 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	PGK1	P00558	417 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ALPI	P09923	528 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	HSMCR30	P0CW71	290 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ANXA3	P12429	323 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	BCKDHA	P12694	445 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	POU2F1	P14859	743 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	PGC	P20142	388 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	TPSB2	P20231	275 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ETV5	P41161	510 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	EMD	P50402	254 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	CRYBA2	P53672	197 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	AP3M2	P53677	418 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ERVK-16	P61578	105 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	BTG1	P62324	171 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	DHODH	Q02127	395 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	RBBP4	Q09028	425 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	BST1	Q10588	318 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	IL18	Q14116	193 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	SLC17A1	Q14916	467 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	TPSAB1	Q15661	275 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	MAPK6	Q16659	721 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	BCL7A	Q4VC05	210 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	LRRC43	Q8N309	656 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	CEP112	Q8N8E3	955 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	M1AP	Q8TC57	530 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ABCC12	Q96J65	1359 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	APOO	Q9BUR5	198 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753		Q9HAA7	133 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	NEK6	Q9HC98	313 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		2.55	□□□□□ -2
HERC4-215	ENST00000515753	NRN1	Q9NPD7	142 aa		2.55	□□□□□ -2

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