RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 DTNBP1Q96EV8 351 aa10.28□□□□□ -0.76
UBE2B-208ENST00000511807 HSH2DQ96JZ2 352 aa10.28□□□□□ -0.76
UBE2B-208ENST00000511807 OSBPL11Q9BXB4 747 aa10.28□□□□□ -0.76
UBE2B-208ENST00000511807 ANGPTL4Q9BY76 406 aa10.28□□□□□ -0.76
UBE2B-208ENST00000511807 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
UBE2B-208ENST00000511807 MAGIXQ9H6Y5 334 aa10.28□□□□□ -0.76
UBE2B-208ENST00000511807 YY1AP1Q9H869 796 aa10.28□□□□□ -0.76
UBE2B-208ENST00000511807 SH2D2AQ9NP31 389 aa10.28□□□□□ -0.76
UBE2B-208ENST00000511807 FLRT3Q9NZU0 649 aa10.28□□□□□ -0.76
UBE2B-208ENST00000511807 Q9UFV3 132 aa10.28□□□□□ -0.76
UBE2B-208ENST00000511807 KCNN3Q9UGI6 736 aa10.28□□□□□ -0.76
UBE2B-208ENST00000511807 PRDM4Q9UKN5 801 aa10.28□□□□□ -0.76
UBE2B-208ENST00000511807 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
UBE2B-208ENST00000511807 SH3GLB1Q9Y371 365 aa10.28□□□□□ -0.76
UBE2B-208ENST00000511807 CSMD2Q7Z408 3487 aa10.28□□□□□ -0.76
UBE2B-208ENST00000511807 F8P00451 2351 aa10.28□□□□□ -0.76
UBE2B-208ENST00000511807 POLQO75417 2590 aa10.27□□□□□ -0.76
UBE2B-208ENST00000511807 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 SUSD5O60279 629 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 WDR1O75083 606 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 CYP7B1O75881 506 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 UQCRBP14927 111 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 ITGA2P17301 1181 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 CCNIQ14094 377 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 HYAL4Q2M3T9 481 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 C1orf185Q5T7R7 199 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 ZFP1Q6P2D0 407 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 ENPP6Q6UWR7 440 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 APOOLQ6UXV4 268 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 CLIP4Q8N3C7 705 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 GATSQ8NAP1 163 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 GPR32P1Q8NGA4 272 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 DUSP19Q8WTR2 217 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 CANT1Q8WVQ1 401 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 NRGNQ92686 78 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 SLC47A1Q96FL8 570 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 SEPHS2Q99611 448 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 TMUB1Q9BVT8 246 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 LAT2Q9GZY6 243 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 SPRR3Q9UBC9 169 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 AURKCQ9UQB9 309 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 WIF1Q9Y5W5 379 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 V9GYQ6 96 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 PCNX1Q96RV3 2341 aa10.27□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 CLDN24A6NM45 220 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 HCRTR2O43614 444 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 HCN1O60741 890 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 FKBP6O75344 327 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 IFNW1P05000 195 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 RFPL3SP0C7P2 107 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 RAP2AP10114 183 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 SLC7A1P30825 629 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 IFNA8P32881 189 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 SLC6A8P48029 635 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 MASP1P48740 699 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 NRF1Q16656 503 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 FNDC7Q5VTL7 733 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 AAGABQ6PD74 315 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 VTCN1Q7Z7D3 282 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 CARM1Q86X55 608 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 LIX1LQ8IVB5 337 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 ADGRG5Q8IZF4 528 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 ARHGDIGQ99819 225 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 SLC6A15Q9H2J7 730 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 PTGES2Q9H7Z7 377 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 ZFP64Q9NPA5 681 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 RLIMQ9NVW2 624 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 CARD8Q9Y2G2 431 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 AP4S1Q9Y587 144 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 HEATR5AQ86XA9 2040 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC168Q8NDH2 2452 aa10.26□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM229AB2RXF0 380 aa10.25□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa10.25□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 AP3D1O14617 1153 aa10.25□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 ENTPD5O75356 428 aa10.25□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 FABP3P05413 133 aa10.25□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 LINGO3P0C6S8 592 aa10.25□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 GABRA1P14867 456 aa10.25□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 PGCP20142 388 aa10.25□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 PTGDSP41222 190 aa10.25□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 OR1E2P47887 323 aa10.25□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 ERFP50548 548 aa10.25□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 P2RX1P51575 399 aa10.25□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 GAS1P54826 345 aa10.25□□□□□ -0.77
UBE2B-208ENST00000511807 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.7 ms