RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496305.5

PHF20-215, Transcript of PHD finger protein 20, human

TSL 4

Gene PHF20, Length 588 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF20-215	ENST00000496305	OR10H3	O60404	316 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	SLITRK3	O94933	977 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	LAP3	P28838	519 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	HSPA2	P54652	639 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	STX17	P56962	302 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	ARL6IP1	Q15041	203 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	PDK3	Q15120	406 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	TMEM123	Q8N131	208 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	SVOPL	Q8N434	492 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	CD274	Q9NZQ7	290 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	PTCH1	Q13635	1447 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	HDAC3	O15379	428 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF264	O43296	627 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	GABRR1	P24046	479 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	RIPPLY3	P57055	190 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	LYZ	P61626	148 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	PMF1	Q6P1K2	205 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	ALLC	Q8N6M5	410 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	OR2L5	Q8NG80	312 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	VCX2	Q9H322	139 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	APMAP	Q9HDC9	416 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	MARCH5	Q9NX47	278 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	COPS3	Q9UNS2	423 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	CLRN2	A0PK11	232 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	HELT	A6NFD8	242 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	KLLN	B2CW77	178 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305		F5H6K3	240 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	HIP1	O00291	1037 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	CXCL13	O43927	109 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	SPAG6	O75602	509 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	GCA	P28676	217 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	LEP	P41159	167 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	BTD	P43251	543 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	RIPK4	P57078	832 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	KLRC3	Q07444	240 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	FGL1	Q08830	312 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	GPM6B	Q13491	265 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	DPYSL2	Q16555	572 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	EOGT	Q5NDL2	527 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	CASC1	Q6TDU7	716 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	VSTM4	Q8IW00	320 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	CEND1	Q8N111	149 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	PIGC	Q92535	297 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	GAL3ST1	Q99999	423 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	RAB34	Q9BZG1	259 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	RAB18	Q9NP72	206 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	IL17C	Q9P0M4	197 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	IFT52	Q9Y366	437 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	TRDC	B7Z8K6	153 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	BBOX1	O75936	387 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	LGALS2	P05162	132 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	MMP11	P24347	488 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	NOV	P48745	357 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	ARFIP1	P53367	373 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	ACTR1A	P61163	376 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	TIMM10	P62072	90 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
PHF20-215	ENST00000496305	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		4.24	□□□□□ -1.73

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms