RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 SLC43A2Q8N370 569 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CADM2Q8N3J6 435 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 TRIML2Q8N7C3 387 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ANKFN1Q8N957 763 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 OR8J2Q8NGG1 315 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 NEUROG1Q92886 237 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF524Q96C55 264 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ZG16BQ96DA0 208 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 MUCL1Q96DR8 90 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 OR11A1Q9GZK7 315 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 NMUR2Q9GZQ4 415 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 COQ10BQ9H8M1 238 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 NGBQ9NPG2 151 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CTPS2Q9NRF8 586 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 KCNE5Q9UJ90 142 aa7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1W2PP18 115 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 TRPC5OSA6NMA1 111 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 NPIPB9F8W1W9 429 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 SDHDO14521 159 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 RFXANKO14593 260 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 AP3D1O14617 1153 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 RAD51DO75771 328 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 PGRP06401 933 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 NID1P14543 1247 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 FOSL1P15407 271 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CDKN2CP42773 168 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 RAC3P60763 192 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 KCNJ10P78508 379 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CASP8Q14790 479 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 TAB1Q15750 504 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 DPY19L1Q2PZI1 675 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 SMU1Q2TAY7 513 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 SYT14P1Q58G82 188 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 C6orf10Q5SRN2 563 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 SAXO2Q658L1 398 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ATG16L1Q676U5 607 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ADAM5Q6NVV9 412 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 TFAP2EQ6VUC0 442 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 SPATA19Q7Z5L4 167 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 GALNT5Q7Z7M9 940 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 KIRREL3Q8IZU9 778 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 OR52N5Q8NH56 324 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 WDR60Q8WVS4 1066 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ST8SIA1Q92185 356 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 TEX37Q96LM6 180 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 BDH2Q9BUT1 245 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 HDHD5Q9BXW7 423 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF350Q9GZX5 532 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CXorf56Q9H5V9 222 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 MANSC1Q9H8J5 431 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 MEAF6Q9HAF1 191 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ACER3Q9NUN7 267 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ASIC5Q9NY37 505 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 EMC3Q9P0I2 261 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CHRNA9Q9UGM1 479 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 POU2F3Q9UKI9 436 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 RNF115Q9Y4L5 304 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ACTL7BQ9Y614 415 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 RTTNQ86VV8 2226 aa7.17□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 USF3Q68DE3 2245 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM247A6NEH6 219 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 HMGN4O00479 90 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 HS3ST1O14792 307 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ANKRD28O15084 1053 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 HDAC3O15379 428 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 KIAA0513O60268 411 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 ERLIN1O75477 346 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 SLC22A3O75751 556 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 LY6G6DO95868 133 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 GKN3PP0CG01 181 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 DHRS4L1P0CG22 281 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 UQCRBP14927 111 aa7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CTPS1-209ENST00000480420 CXCR1P25024 350 aa7.16□□□□□ -1.26
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