RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 HEATR5AQ86XA9 2040 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A087WUJ7 227 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 TNFRSF11BO00300 401 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 MGRN1O60291 552 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 ZIC3O60481 467 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 E2F6O75461 281 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 NTN1O95631 604 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 ANPEPP15144 967 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 MST1P26927 711 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 ELK4P28324 431 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 RFC3P40938 356 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 RBM34P42696 430 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 MAGEA5P43359 124 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 HMGA2P52926 109 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 KLRB1Q12918 225 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 FOXF1Q12946 379 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 RCN1Q15293 331 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 NADK2Q4G0N4 442 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 FGD3Q5JSP0 725 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 DCST1Q5T197 706 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 RAET1LQ5VY80 246 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM180AQ6UWF9 173 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 C5orf46Q6UWT4 87 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 RRM2BQ7LG56 351 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 PQLC1Q8N2U9 271 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00471Q8N535 108 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 LRTOMTQ8WZ04 291 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 SFXN2Q96NB2 322 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 EPYCQ99645 322 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 KLHDC3Q9BQ90 382 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC19A3Q9BZV2 496 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 RHCGQ9UBD6 479 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 CHRNA9Q9UGM1 479 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 OSGIN1Q9UJX0 560 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 TMED7Q9Y3B3 224 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 EML6Q6ZMW3 1958 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 PKD1L2Q7Z442 2459 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 OR2M5A3KFT3 312 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 HTR3EA5X5Y0 456 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 GJE1A6NN92 205 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 H0Y3Z8 333 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF208O43345 1280 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 SUSD5O60279 629 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 HCN1O60741 890 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 CCNB2O95067 398 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 LYPD3O95274 346 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 THY1P04216 161 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 FPR1P21462 350 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 CHMP24386 653 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 IFNGR2P38484 337 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 CLK1P49759 484 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 SELENBP1Q13228 472 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM44Q2T9K0 475 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 C3orf33Q6P1S2 294 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 POMZP3Q6PJE2 187 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00114Q6XXX2 140 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF730Q6ZMV8 503 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 AMIGO2Q86SJ2 522 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 ADGRG3Q86Y34 549 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 HIPK1Q86Z02 1210 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 SVOPLQ8N434 492 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 OR52J3Q8NH60 311 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 OR5K1Q8NHB7 308 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 POC1BQ8TC44 478 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 STK35Q8TDR2 534 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM239Q8WW34 195 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF524Q96C55 264 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 SDCCAG3Q96C92 435 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 DDIT4LQ96D03 193 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 NRBF2Q96F24 287 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 ALPK1Q96QP1 1244 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 PKP2Q99959 881 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM43Q9BTV4 400 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 LDAHQ9H6V9 325 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 EXO5Q9H790 373 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 MED31Q9Y3C7 131 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 AP4B1Q9Y6B7 739 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-208ENST00000462602 ZFHX4Q86UP3 3567 aa8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms