RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 NPIPB8E9PQR5 432 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 H7C417 338 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 KIAA0513O60268 411 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 PGM3O95394 542 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 C6orf47O95873 294 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 BCKDHAP12694 445 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 APEHP13798 732 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 MAPK1P28482 360 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 RPL3P39023 403 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 GZMKP49863 264 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 PDLIM4P50479 330 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 EFNA4P52798 201 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 DNAJB13P59910 316 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 RPS26P62854 115 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 GPR68Q15743 365 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 CCDC153Q494R4 210 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 SYT14P1Q58G82 188 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 FBXW9Q5XUX1 488 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF544Q6NX49 715 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 CASP12Q6UXS9 341 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF563Q8TA94 476 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF524Q96C55 264 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 MTERF3Q96E29 417 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 FBXO17Q96EF6 278 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 FCRL1Q96LA6 429 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 OR7D2Q96RA2 312 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 INPP5KQ9BT40 448 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 C1orf50Q9BV19 199 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 FKRPQ9H9S5 495 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 ASB6Q9NWX5 421 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 TAS2R16Q9NYV7 291 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 GIMAP2Q9UG22 337 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 SLC25A15Q9Y619 301 aa9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 GOLGA8OA6NCC3 632 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 SERINC4A6NH21 518 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM233B4DJY2 109 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 GOLGA8NF8WBI6 632 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 COPEO14579 308 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 LSM1O15116 133 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 PLIN3O60664 434 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 CSTAP01040 98 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 LAMP1P11279 417 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 CPA3P15088 417 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 PGCP20142 388 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 SESN3P58005 492 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 SKP2Q13309 424 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 MLC1Q15049 377 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 IQCCQ4KMZ1 466 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 SLC25A53Q5H9E4 307 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 FAM120AOSQ5T036 256 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 KANK2Q63ZY3 851 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 KLHL24Q6TFL4 600 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 TMPPEQ6ZT21 453 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 OLIG3Q7RTU3 272 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 MNS1Q8NEH6 495 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 OR52E4Q8NGH9 312 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 PIGXQ8TBF5 258 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 AGR3Q8TD06 166 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 SFXN5Q8TD22 340 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 TWIST2Q8WVJ9 160 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM234Q8WY98 164 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 OR5P2Q8WZ92 322 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 ST8SIA1Q92185 356 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 PROX1Q92786 737 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 SLC35G5Q96KT7 338 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 LAT2Q9GZY6 243 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 TUBB1Q9H4B7 451 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 ATAD3AQ9NVI7 634 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 GPATCH2Q9NW75 528 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 OXSMQ9NWU1 459 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 UPB1Q9UBR1 384 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 ATP6V1HQ9UI12 483 aa9.05□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa9.04□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 SLC35F4A4IF30 521 aa9.04□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 GPR171O14626 319 aa9.04□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 PIP5K1BO14986 540 aa9.04□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 ITGA5P08648 1049 aa9.04□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 CCNA2P20248 432 aa9.04□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 RYKP34925 604 aa9.04□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 CCT5P48643 541 aa9.04□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 OR2B6P58173 313 aa9.04□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
DDX39B-211ENST00000449757 PHC1P78364 1004 aa9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms