RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	ALG5	Q9Y673	324 aa		15.61	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	OR5K3	A6NET4	321 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	OR5K4	A6NMS3	321 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058		J3QLW9	94 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	CTSB	P07858	339 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF19	P17023	458 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	RABIF	P47224	123 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	RFX3	P48380	749 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	OR12D2	P58182	307 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	SLC3A1	Q07837	685 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	POU4F2	Q12837	409 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF614	Q8N883	585 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	SLC43A1	O75387	559 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	YES1	P07947	543 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	GABRG2	P18507	467 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	TEX19	Q8NA77	164 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	PEX11G	Q96HA9	241 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	RASD1	Q9Y272	281 aa		15.6	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	AGRP	O00253	132 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	SEMA4F	O95754	770 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	IFNG	P01579	166 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	ST6GAL1	P15907	406 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	NPR2	P20594	1047 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	INPP1	P49441	399 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	NRG3	P56975	720 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	OR10A3	P58181	314 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	CD83	Q01151	205 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	15.59	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF141	Q15928	474 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	SSX6	Q7RTT6	188 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	OOSP2	Q86WS3	158 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	15.59	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	OR5J2	Q8NH18	312 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	VSTM2L	Q96N03	204 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	BEX2	Q9BXY8	128 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	15.59	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	15.59	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	POMT2	Q9UKY4	750 aa		15.59	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		15.58	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	GYPB	P06028	91 aa		15.58	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	IGHV4-34	P06331	123 aa		15.58	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	15.58	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	GAS6	Q14393	721 aa		15.58	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	FGFBP1	Q14512	234 aa		15.58	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		15.58	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		15.58	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		15.58	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	RPTN	Q6XPR3	784 aa		15.58	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		15.58	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	TRIM63	Q969Q1	353 aa		15.58	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	LRFN5	Q96NI6	719 aa		15.58	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	WAC	Q9BTA9	647 aa		15.58	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		15.58	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		15.58	■□□□□ 0.09
TOM1-210	ENST00000449058	MYO9B	Q13459	2157 aa		15.58	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		15.58	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	15.58	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	15.58	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	FAM53B	Q14153	422 aa		15.58	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		15.58	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	15.58	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	ULK3	Q6PHR2	472 aa		15.58	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		15.58	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		15.58	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		15.58	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		15.58	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	15.58	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		15.58	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	15.58	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	HRK	O00198	91 aa		15.57	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	FOXS1	O43638	330 aa		15.57	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	TFPI	P10646	304 aa		15.57	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	PYCR1	P32322	319 aa		15.57	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	ACVR1B	P36896	505 aa		15.57	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	TALDO1	P37837	337 aa		15.57	■□□□□ 0.08

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