RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 PAX1P15863 534 aa13.46□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 OR3A2P47893 321 aa13.46□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 DIO1P49895 249 aa13.46□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 TAB1Q15750 504 aa13.46□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 AP1ARQ63HQ0 302 aa13.46□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 ADAM5Q6NVV9 412 aa13.46□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 Q71RC1 249 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 ZNF100Q8IYN0 542 aa13.46□□□□□ -0.25
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HERC3-206ENST00000431413 PANX1Q96RD7 426 aa13.46□□□□□ -0.25
HERC3-206ENST00000431413 ZBTB18Q99592 522 aa13.46□□□□□ -0.25
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HERC3-206ENST00000431413 LIPT1Q9Y234 373 aa13.46□□□□□ -0.25
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HERC3-206ENST00000431413 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
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HERC3-206ENST00000431413 GNA13Q14344 377 aa13.45□□□□□ -0.26
HERC3-206ENST00000431413 TSC22D1Q15714 1073 aa13.45□□□□□ -0.26
HERC3-206ENST00000431413 MAPK14Q16539 360 aa13.45□□□□□ -0.26
HERC3-206ENST00000431413 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa13.45□□□□□ -0.26
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HERC3-206ENST00000431413 OLIG3Q7RTU3 272 aa13.45□□□□□ -0.26
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HERC3-206ENST00000431413 SPATA19Q7Z5L4 167 aa13.45□□□□□ -0.26
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HERC3-206ENST00000431413 FBXW5Q969U6 566 aa13.45□□□□□ -0.26
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HERC3-206ENST00000431413 PNPOQ9NVS9 261 aa13.45□□□□□ -0.26
HERC3-206ENST00000431413 CHRNA9Q9UGM1 479 aa13.45□□□□□ -0.26
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HERC3-206ENST00000431413 DSCAMO60469 2012 aa13.45□□□□□ -0.26
HERC3-206ENST00000431413 ROS1P08922 2347 aa13.45□□□□□ -0.26
HERC3-206ENST00000431413 ZNF814B7Z6K7 855 aa13.44□□□□□ -0.26
HERC3-206ENST00000431413 GPR171O14626 319 aa13.44□□□□□ -0.26
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HERC3-206ENST00000431413 PMM1Q92871 262 aa13.44□□□□□ -0.26
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HERC3-206ENST00000431413 OR52E6Q96RD3 313 aa13.44□□□□□ -0.26
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HERC3-206ENST00000431413 THAP1Q9NVV9 213 aa13.44□□□□□ -0.26
HERC3-206ENST00000431413 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
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HERC3-206ENST00000431413 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa13.44□□□□□ -0.26
HERC3-206ENST00000431413 VPS13CQ709C8 3753 aa13.44□□□□□ -0.26
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HERC3-206ENST00000431413 C9JVG2 144 aa13.43□□□□□ -0.26
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HERC3-206ENST00000431413 GGT1P19440 569 aa13.43□□□□□ -0.26
HERC3-206ENST00000431413 MAP2K6P52564 334 aa13.43□□□□□ -0.26
HERC3-206ENST00000431413 NME5P56597 212 aa13.43□□□□□ -0.26
HERC3-206ENST00000431413 UFM1P61960 85 aa13.43□□□□□ -0.26
HERC3-206ENST00000431413 CHRNEQ04844 493 aa13.43□□□□□ -0.26
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HERC3-206ENST00000431413 STK11Q15831 433 aa13.43□□□□□ -0.26
HERC3-206ENST00000431413 ATG16L1Q676U5 607 aa13.43□□□□□ -0.26
HERC3-206ENST00000431413 RNF130Q86XS8 419 aa13.43□□□□□ -0.26
HERC3-206ENST00000431413 UBE2J2Q8N2K1 259 aa13.43□□□□□ -0.26
HERC3-206ENST00000431413 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
HERC3-206ENST00000431413 PIGXQ8TBF5 258 aa13.43□□□□□ -0.26
HERC3-206ENST00000431413 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa13.43□□□□□ -0.26
HERC3-206ENST00000431413 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
HERC3-206ENST00000431413 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
HERC3-206ENST00000431413 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
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