RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426660.1

CLUHP2-201, Transcript of clustered mitochondria homolog pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene CLUHP2, Length 1,303 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUHP2-201ENST00000426660 C7orf34Q96L11 122 aa13.58□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 TIMP4Q99727 224 aa13.58□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 TRIM15Q9C019 465 aa13.58□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 TMEM185BQ9H7F4 350 aa13.58□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 TMEM27Q9HBJ8 222 aa13.58□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa13.58□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 MPDZO75970 2070 aa13.58□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 A0A0B4J2E0 115 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 A0A1B0GX12 115 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 AQP12BA6NM10 295 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 J3KTA2 159 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 hCG_2039718K7EN88 272 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 ACTL6AO96019 429 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 IFNW1P05000 195 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 PEPDP12955 493 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 CCNA2P20248 432 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 FUT4P22083 530 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 SHC1P29353 583 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 PTGS2P35354 604 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 HTR3AP46098 478 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 CDH12P55289 794 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 CLDN18P56856 261 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 IGFBP7Q16270 282 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 C3AR1Q16581 482 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 C1orf146Q5VVC0 180 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 SPATA24Q86W54 205 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 AQP12AQ8IXF9 295 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 ADGRG5Q8IZF4 528 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 SMPDL3BQ92485 455 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 SLC47A1Q96FL8 570 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 SEPHS2Q99611 448 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 PRDM4Q9UKN5 801 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 A4GNTQ9UNA3 340 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 CHD6Q8TD26 2715 aa13.57□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 TMEM72A0PK05 275 aa13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 OR14I1A6ND48 311 aa13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 ANKRD65E5RJM6 399 aa13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 H0YC42 278 aa13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 LINC01387J3KSC0 135 aa13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 FFAR1O14842 300 aa13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 CIB2O75838 187 aa13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 LYPD3O95274 346 aa13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 NQO1P15559 274 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 ELK4P28324 431 aa13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 GCKP35557 465 aa13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 CLDN15P56746 228 aa13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 TAS2R41P59536 307 aa13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 RAC1P63000 192 aa13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 SELENBP1Q13228 472 aa13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 CCNIQ14094 377 aa13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 IQCCQ4KMZ1 466 aa13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 ALG10BQ5I7T1 473 aa13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 ZNF613Q6PF04 617 aa13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 LILRA2Q8N149 483 aa13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 SARAFQ96BY9 339 aa13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 WDYHV1Q96HA8 205 aa13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 NDUFAF4Q9P032 175 aa13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 CHRNA9Q9UGM1 479 aa13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 TMED7Q9Y3B3 224 aa13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 AP4B1Q9Y6B7 739 aa13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 ENPP4Q9Y6X5 453 aa13.56□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 TRAPPC13A5PLN9 417 aa13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 DIRAS1O95057 198 aa13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 MT-ND1P03886 318 aa13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 ZNF708P17019 499 aa13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 SFTPDP35247 375 aa13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 CLDN20P56880 219 aa13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 SRYQ05066 204 aa13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 ULK3Q6PHR2 472 aa13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 WDR88Q6ZMY6 472 aa13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 GDF7Q7Z4P5 450 aa13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 GGNQ86UU5 652 aa13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 UBQLNLQ8IYU4 475 aa13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 OR5M9Q8NGP3 310 aa13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 FAM57AQ8TBR7 257 aa13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 CANT1Q8WVQ1 401 aa13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 SLC41A3Q96GZ6 507 aa13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 PRRC1Q96M27 445 aa13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 MAGIXQ9H6Y5 334 aa13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 IL1RAPQ9NPH3 570 aa13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 SERINC1Q9NRX5 453 aa13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 PNPLA3Q9NST1 481 aa13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 RHCGQ9UBD6 479 aa13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 RIMS3Q9UJD0 308 aa13.55□□□□□ -0.24
CLUHP2-201ENST00000426660 ACAD8Q9UKU7 415 aa13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms