RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-208ENST00000392449 CYTIPO60759 359 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 IGHV3-9P01782 118 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 SOD3P08294 240 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 LBPP18428 481 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 CCNA2P20248 432 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 PCSK6P29122 969 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 IL12AP29459 219 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 OR3A2P47893 321 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 UFM1P61960 85 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 CHRNEQ04844 493 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 BST1Q10588 318 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 STX3Q13277 289 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 STK11Q15831 433 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 SYT14P1Q58G82 188 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 NCMAPQ5T1S8 102 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 FAM71CQ8NEG0 241 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 KBTBD8Q8NFY9 601 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 ST8SIA1Q92185 356 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 INPP5KQ9BT40 448 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 BDH2Q9BUT1 245 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 HDHD5Q9BXW7 423 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 OR11A1Q9GZK7 315 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 GP6Q9HCN6 339 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 ACER3Q9NUN7 267 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 HAO1Q9UJM8 370 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 RNF115Q9Y4L5 304 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 E9PBE3 544 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 SULT2B1O00204 365 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 TFPIP10646 304 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 PGCP20142 388 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 CDKN2CP42773 168 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 KHKP50053 298 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 ATP5J2P56134 94 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 BSPH1Q075Z2 132 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 ITGADQ13349 1161 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 GPAT3Q53EU6 434 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 ATAD3BQ5T9A4 648 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 ANXA8L1Q5VT79 327 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 ADAM5Q6NVV9 412 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 Q6ZT83 130 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 RNF130Q86XS8 419 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 ANKFN1Q8N957 763 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF563Q8TA94 476 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 NEURL3Q96EH8 262 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 ARL5BQ96KC2 179 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 CCDC106Q9BWC9 280 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 CXorf56Q9H5V9 222 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 MEAF6Q9HAF1 191 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 ABCA2Q9BZC7 2435 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 GOLGA8OA6NCC3 632 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 DPRXA6NFQ7 191 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 GOLGA8NF8WBI6 632 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 HMGN4O00479 90 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 SDHDO14521 159 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 AP3D1O14617 1153 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 RAMP1O60894 148 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 GSNP06396 782 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 CD3EP07766 207 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 IGHV1-2P23083 117 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 S100A3P33764 101 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 P2RY6Q15077 328 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 SYPL1Q16563 259 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 TMPPEQ6ZT21 453 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 TMEM234Q8WY98 164 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 HSD17B8Q92506 261 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 POTEKPQ9BYX7 375 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 SAP130Q9H0E3 1048 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 SERINC1Q9NRX5 453 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 CHRM4P08173 479 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 PAX1P15863 534 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 NTF4P34130 210 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 CDKN1AP38936 164 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 KCNJ10P78508 379 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 COX20Q5RI15 118 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 VPS37AQ8NEZ2 397 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 CCDC115Q96NT0 180 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 AIG1Q9NVV5 245 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 CHRNA9Q9UGM1 479 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 DNHD1Q96M86 4753 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-208ENST00000392449 CCDC154A6NI56 674 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms