RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 A8MXE2 369 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 LINC01387J3KSC0 135 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 SYT5O00445 386 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 FAAHO00519 579 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 NME4O00746 187 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 MRASO14807 208 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ANGPT2O15123 496 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 SLC22A2O15244 555 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 NPIPB7O75200 414 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 LYPD3O95274 346 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 NUDT14O95848 222 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 LGI1O95970 557 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 IL18BPO95998 194 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 IL2RAP01589 272 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 OPN1SWP03999 348 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 THBS1P07996 1170 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 COX4I1P13073 169 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ETS2P15036 469 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 IL7RP16871 459 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 PGCP20142 388 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 CCNA2P20248 432 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 CD247P20963 164 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 BMP5P22003 454 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 PPIBP23284 216 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 CTSSP25774 331 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ELK4P28324 431 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ADH6P28332 368 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 TACR3P29371 465 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 CCKARP32238 428 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 OPRM1P35372 400 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 EIF1P41567 113 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 P2RY4P51582 365 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 CCR4P51679 360 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 CRISP3P54108 245 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 EGR4Q05215 589 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 LTBQ06643 244 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 MERTKQ12866 999 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 BNIP2Q12982 314 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 SELENBP1Q13228 472 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 SCARB2Q14108 478 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 PON3Q15166 354 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 NPTX1Q15818 432 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 HSPB2Q16082 182 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 VMACQ2NL98 169 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 LIN52Q52LA3 116 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 COQ5Q5HYK3 327 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF311Q5JNZ3 666 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 HBMQ6B0K9 141 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 REEP3Q6NUK4 255 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 CCDC80Q76M96 950 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 GRINAQ7Z429 371 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 CMIPQ8IY22 773 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 SLC15A3Q8IY34 581 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 PEX5LQ8IYB4 626 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 EID3Q8N140 333 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 MEIOBQ8N635 442 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF610Q8N9Z0 462 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 SMYD1Q8NB12 490 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 BBS10Q8TAM1 723 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 RNF128Q8TEB7 428 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ABHD3Q8WU67 409 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ASB5Q8WWX0 329 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ST8SIA1Q92185 356 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 PMM1Q92871 262 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 C3orf49Q96BT1 292 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 TAMM41Q96BW9 452 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 MRGPRX4Q96LA9 322 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 KLHL15Q96M94 604 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ARHGDIGQ99819 225 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 SPOCK3Q9BQ16 436 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 SPATA9Q9BWV2 254 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 OR11A1Q9GZK7 315 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 RAD21L1Q9H4I0 556 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 KCNJ16Q9NPI9 418 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ARL8BQ9NVJ2 186 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 COQ3Q9NZJ6 369 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 CALML5Q9NZT1 146 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 OSGIN1Q9UJX0 560 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 PACSIN3Q9UKS6 424 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 IFT52Q9Y366 437 aa3.1□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 TMED7Q9Y3B3 224 aa3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms