RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525315.5

CTSB-209, Transcript of cathepsin B, human

TSL 2

Gene CTSB, Length 586 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSB-209	ENST00000525315	NFYC	Q13952	458 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	MAPRE2	Q15555	327 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	ZNF787	Q6DD87	383 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	REEP3	Q6NUK4	255 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	VRK2	Q86Y07	508 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	OR10D3	Q8NH80	312 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	BBS10	Q8TAM1	723 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	FIG4	Q92562	907 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	PINK1	Q9BXM7	581 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	JKAMP	Q9P055	326 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	SLC22A20	A6NK97	555 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	GJE1	A6NN92	205 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	SYT5	O00445	386 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	CCDC22	O60826	627 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	KRT34	O76011	436 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	IGFBP2	P18065	325 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	BMP5	P22003	454 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	SHC1	P29353	583 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	GZMM	P51124	257 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	GYS2	P54840	703 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	CARD18	P57730	90 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	CDK6	Q00534	326 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	EPS8	Q12929	822 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	SELENBP1	Q13228	472 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	SELPLG	Q14242	412 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	PON3	Q15166	354 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	SGCB	Q16585	318 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	LIN52	Q52LA3	116 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	RNF220	Q5VTB9	566 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	HBM	Q6B0K9	141 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	OR2A2	Q6IF42	318 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	SPATA21	Q7Z572	469 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	PTOV1	Q86YD1	416 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	NFKBID	Q8NI38	313 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	ZNF563	Q8TA94	476 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	OSTF1	Q92882	214 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	KLHL15	Q96M94	604 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	ADAM19	Q9H013	955 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	NANOG	Q9H9S0	305 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	RNF122	Q9H9V4	155 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	RLIM	Q9NVW2	624 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	ITPR2	Q14571	2701 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	CFAP73	A6NFT4	308 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	C5orf58	C9J3I9	102 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	AP3D1	O14617	1153 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	TNFSF11	O14788	317 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	CXCL13	O43927	109 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	SNX3	O60493	162 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	SLC6A2	P23975	617 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	RYK	P34925	604 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	SFTPD	P35247	375 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	HTR3A	P46098	478 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	RBBP4	Q09028	425 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	MERTK	Q12866	999 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	SCARB2	Q14108	478 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	REP15	Q6BDI9	236 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	GRINA	Q7Z429	371 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CTSB-209	ENST00000525315	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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