RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516217.1

RNU6-1262P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1262, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1262P, Length 96 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1262P-201ENST00000516217 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CNPP09543 421 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 PRPS2P11908 318 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TMEM11P17152 192 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 PSMB5P28074 263 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ABCD1P33897 745 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CRKLP46109 303 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ACTR2P61160 394 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 PPP1CBP62140 327 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CACNG1Q06432 222 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SLC34A1Q06495 639 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CUL3Q13618 768 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 KRT32Q14532 448 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 NPTX1Q15818 432 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TIGD6Q17RP2 521 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 PGGHGQ32M88 737 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 C12orf74Q32Q52 190 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 FUT11Q495W5 492 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ZNF542PQ5EBM4 170 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 FAM46CQ5VWP2 391 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TANGO2Q6ICL3 276 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CDC73Q6P1J9 531 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 PRMT9Q6P2P2 845 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 FUT10Q6P4F1 479 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 C17orf107Q6ZR85 190 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TCF23Q7RTU1 214 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 JAZF1Q86VZ6 243 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 PLA2G4DQ86XP0 818 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TAGAPQ8N103 731 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 LINC01561Q8N1V8 128 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TCAIMQ8N3R3 496 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CCDC63Q8NA47 563 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 OR51G2Q8NGK0 314 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 OR13C5Q8NGS8 318 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ACTRT1Q8TDG2 376 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 PATE1Q8WXA2 126 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SLAMF9Q96A28 289 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SLC35C1Q96A29 364 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TM4SF19Q96DZ7 209 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 MAP7D2Q96T17 732 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CCT7Q99832 543 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SH3GL3Q99963 347 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 REEP2Q9BRK0 252 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 DESI2Q9BSY9 194 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TBCDQ9BTW9 1192 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CHAC1Q9BUX1 264 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 KCNK15Q9H427 330 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 MED9Q9NWA0 146 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TMCC3Q9ULS5 477 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SLC7A11Q9UPY5 501 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ITPR3Q14573 2671 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 WNK1Q9H4A3 2382 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CCDC162PA2VCL2 907 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 PRSS37A4D1T9 235 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 E5RGE8 158 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 BPY2O14599 106 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 RASGRF2O14827 1237 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SH3BP5O60239 455 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 KIAA0513O60268 411 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 RFPL1O75677 317 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 MFN2O95140 757 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CELF2O95319 508 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 GSRP00390 522 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 P04436 131 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 F2RP25116 425 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CHMLP26374 656 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CD1CP29017 333 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SAA4P35542 130 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 PGM1P36871 562 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 OR3A3P47888 321 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 NEK2P51955 445 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ERCC8Q13216 396 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 STARD3Q14849 445 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 RBBP7Q16576 425 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 CCNG2Q16589 344 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ZNF699Q32M78 642 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SMUG1Q53HV7 270 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ANKRD22Q5VYY1 191 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 SLC25A25Q6KCM7 469 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 MED27Q6P2C8 311 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-1262P-201ENST00000516217 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP-1.49□□□□□ -2.65
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