RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	NANS	Q9NR45	359 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	NCOA1	Q15788	1441 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ZFP92	A6NM28	416 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	WWP2	O00308	870 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	OR7A17	O14581	309 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	HDAC3	O15379	428 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	MSH4	O15457	936 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	MAGEB3	O15480	346 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	CABYR	O75952	493 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ALOX5	P09917	674 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	PGC	P20142	388 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ZP3	P21754	424 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	OTX2	P32243	289 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	GCK	P35557	465 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	AP3M2	P53677	418 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	RAB40B	Q12829	278 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	TIGIT	Q495A1	244 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	SBK1	Q52WX2	424 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM122A	Q96E09	287 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	MAGEB18	Q96M61	343 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	TXN2	Q99757	166 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	OMD	Q99983	421 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	EDEM2	Q9BV94	578 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF702P	Q9H963	129 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	FANCF	Q9NPI8	374 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	USP16	Q9Y5T5	823 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	C3	P01024	1663 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	KIF27	Q86VH2	1401 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284		B4DXG7	233 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284		G3V4G9	280 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	SERF1A	O75920	110 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	RHOBTB1	O94844	696 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	IQCF3	P0C7M6	154 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	GPR89B	P0CG08	455 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	STAR	P49675	285 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	EFNA3	P52797	238 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	TTC23	Q5W5X9	447 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	WSCD1	Q658N2	575 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ATL3	Q6DD88	541 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	SYT14	Q8NB59	555 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM3C	Q92520	227 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	PDF	Q9HBH1	243 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF221	Q9UK13	617 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	PDE10A	Q9Y233	779 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	GOLGA3	Q08378	1498 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284		A0A1W2PNV4	684 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284		K7ENP7	123 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	TBL1X	O60907	577 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	MTX2	O75431	263 aa		3.11	□□□□□ -1.91

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