RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495188.2

RNF146-208, Transcript of ring finger protein 146, human

TSL 2

Gene RNF146, Length 593 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF146-208	ENST00000495188	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RNF146-208	ENST00000495188	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RNF146-208	ENST00000495188	CACNG2	Q9Y698	323 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RNF146-208	ENST00000495188	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RNF146-208	ENST00000495188	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RNF146-208	ENST00000495188		A0A1B0GUL7	405 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RNF146-208	ENST00000495188	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
RNF146-208	ENST00000495188	INS	P01308	110 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RNF146-208	ENST00000495188	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
RNF146-208	ENST00000495188	NUDT1	P36639	197 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RNF146-208	ENST00000495188	LRRC63	Q05C16	580 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RNF146-208	ENST00000495188	CUL1	Q13616	776 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RNF146-208	ENST00000495188	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RNF146-208	ENST00000495188	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RNF146-208	ENST00000495188	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
RNF146-208	ENST00000495188	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RNF146-208	ENST00000495188	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RNF146-208	ENST00000495188	SLC6A7	Q99884	636 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RNF146-208	ENST00000495188	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF225	Q9UK10	706 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RNF146-208	ENST00000495188	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RNF146-208	ENST00000495188	ARID1A	O14497	2285 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	CTAGE5	O15320	804 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	GNA14	O95837	355 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	PGC	P20142	388 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	TBXA2R	P21731	343 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	CYP2F1	P24903	491 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	IL1RL1	Q01638	556 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	UCN3	Q969E3	161 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	WDR76	Q9H967	626 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	ALG6	Q9Y672	507 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	GSAP	A4D1B5	854 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	MBD3	O95983	291 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	TPSB2	P20231	275 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	CYP2B6	P20813	491 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	COX7A1	P24310	79 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	TPSAB1	Q15661	275 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	SVOPL	Q8N434	492 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	GAL3ST1	Q99999	423 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188		E7ESA3	106 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	MSH4	O15457	936 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	PRKY	O43930	277 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	PPOX	P50336	477 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	PRKX	P51817	358 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	3.56	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	SCGB2A2	Q13296	93 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	INA	Q16352	499 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	C12orf60	Q5U649	245 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	TPRA1	Q86W33	373 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	SLC25A22	Q9H936	323 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	AIG1	Q9NVV5	245 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	SCN2A	Q99250	2005 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188		A0A087WZY1	265 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188		A0A0G2JRQ6	117 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	GJE1	A6NN92	205 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	CCNC	P24863	283 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	HTR1F	P30939	366 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	NUCB2	P80303	420 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	UNC119	Q13432	240 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	ARL6IP1	Q15041	203 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF786	Q8N393	782 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	FAM151A	Q8WW52	585 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	STARD4	Q96DR4	205 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	C12orf66	Q96MD2	445 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	CALHM2	Q9HA72	323 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	NUDT15	Q9NV35	164 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	TREM2	Q9NZC2	230 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RNF146-208	ENST00000495188	ASF1A	Q9Y294	204 aa		3.55	□□□□□ -1.84

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