RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488403.5

NOP58-208, Transcript of NOP58 ribonucleoprotein, human

TSL 2

Gene NOP58, Length 871 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NOP58-208	ENST00000488403	MAL2	Q969L2	176 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	MED13L	Q71F56	2210 aa		13.25	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	CLDN24	A6NM45	220 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	CLCA1	A8K7I4	914 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	HSPB2	A8KAH6	182 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	PGM3	O95394	542 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	THBS1	P07996	1170 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	UQCRB	P14927	111 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	PRKCA	P17252	672 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	ELK4	P28324	431 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	RYK	P34925	604 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	MTPN	P58546	118 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	RAC1	P63000	192 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	HSPB2	Q16082	182 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	FBXO27	Q8NI29	283 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	ST8SIA1	Q92185	356 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	GJE1	A6NN92	205 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	ETS2	P15036	469 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	TIMP3	P35625	211 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	CLDN20	P56880	219 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	SESN3	P58005	492 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	RBBP4	Q09028	425 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	SCARB2	Q14108	478 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	SGCB	Q16585	318 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	VRK2	Q86Y07	508 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	LILRA2	Q8N149	483 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	NAXE	Q8NCW5	288 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	POC1B	Q8TC44	478 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	WNT2B	Q93097	391 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	LRRC58	Q96CX6	371 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF607	Q96SK3	696 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	NPAS1	Q99742	590 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	TM9SF2	Q99805	663 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	ACER3	Q9NUN7	267 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	AKAP6	Q13023	2319 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	CFAP73	A6NFT4	308 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	DNAJA2	O60884	412 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	OPN1LW	P04000	364 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	COX4I1	P13073	169 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	BMP5	P22003	454 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	UQCRC1	P31930	480 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	CLDN15	P56746	228 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	MERTK	Q12866	999 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF550	Q7Z398	422 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	C10orf111	Q8N326	155 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	HIPK4	Q8NE63	616 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	RCN3	Q96D15	328 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	KLHL15	Q96M94	604 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	UCN2	Q96RP3	112 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NOP58-208	ENST00000488403	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		13.22	□□□□□ -0.29

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