RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486204.5

SSR4-211, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 3

Gene SSR4, Length 658 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-211ENST00000486204 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa11.64□□□□□ -0.55
SSR4-211ENST00000486204 ZNF337Q9Y3M9 751 aa11.64□□□□□ -0.55
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SSR4-211ENST00000486204 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
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SSR4-211ENST00000486204 CAMK2AQ9UQM7 478 aa11.63□□□□□ -0.55
SSR4-211ENST00000486204 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SSR4-211ENST00000486204 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SSR4-211ENST00000486204 VPS13CQ709C8 3753 aa11.63□□□□□ -0.55
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SSR4-211ENST00000486204 TMEM247A6NEH6 219 aa11.62□□□□□ -0.55
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SSR4-211ENST00000486204 H3BML4 177 aa11.62□□□□□ -0.55
SSR4-211ENST00000486204 LINC01387J3KSC0 135 aa11.62□□□□□ -0.55
SSR4-211ENST00000486204 EFNA2O43921 213 aa11.62□□□□□ -0.55
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SSR4-211ENST00000486204 CYP7B1O75881 506 aa11.62□□□□□ -0.55
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SSR4-211ENST00000486204 EPPINO95925 133 aa11.62□□□□□ -0.55
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SSR4-211ENST00000486204 CYP51A1Q16850 503 aa11.61□□□□□ -0.55
SSR4-211ENST00000486204 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SSR4-211ENST00000486204 HACD2Q6Y1H2 254 aa11.61□□□□□ -0.55
SSR4-211ENST00000486204 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
SSR4-211ENST00000486204 EID3Q8N140 333 aa11.61□□□□□ -0.55
SSR4-211ENST00000486204 CLIP4Q8N3C7 705 aa11.61□□□□□ -0.55
SSR4-211ENST00000486204 C11orf65Q8NCR3 313 aa11.61□□□□□ -0.55
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