RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485019.1

RBM34-208, Transcript of RNA binding motif protein 34, human

TSL 3

Gene RBM34, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM34-208	ENST00000485019	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	PRG2	P13727	222 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	NCK1	P16333	377 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF708	P17019	499 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	CCNA2	P20248	432 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	ELK4	P28324	431 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	SFTPD	P35247	375 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	PTGER4	P35408	488 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	HTR3A	P46098	478 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	PER3	P56645	1201 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	CLDN18	P56856	261 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	CLDN20	P56880	219 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	HOXC5	Q00444	222 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	SELENBP1	Q13228	472 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	SGCB	Q16585	318 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	GLYAT	Q6IB77	296 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	RPTN	Q6XPR3	784 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	GRINA	Q7Z429	371 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	PROX1	Q92786	737 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	SLC35B4	Q969S0	331 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	FAM162A	Q96A26	154 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	TPD52L3	Q96J77	140 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	BAG5	Q9UL15	447 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	MEMO1	Q9Y316	297 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	ATRX	P46100	2492 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	GJE1	A6NN92	205 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019		E9PLN8	166 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019		H0YC42	278 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019		M0R3H8	397 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	SYT5	O00445	386 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	FAAH	O00519	579 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	SEMA7A	O75326	666 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	NTN1	O95631	604 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	EPPIN	O95925	133 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	C8B	P07358	591 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	IL11	P20809	199 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	CD247	P20963	164 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	CXCR1	P25024	350 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	HTR1E	P28566	365 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	TACR3	P29371	465 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	CPOX	P36551	454 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	SLC1A3	P43003	542 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	MTFR2	Q6P444	385 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	COMTD1	Q86VU5	262 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	RNF217	Q8TC41	542 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	LZIC	Q8WZA0	190 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	ARHGDIG	Q99819	225 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	NCKAP5	O14513	1909 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	TNFSF11	O14788	317 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	GYG2	O15488	501 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	EFNA2	O43921	213 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF682	O95780	498 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	SERPINA1	P01009	418 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	TFPI	P10646	304 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	HSD17B1	P14061	328 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	GGT1	P19440	569 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	SLC7A1	P30825	629 aa		11.48	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
RBM34-208	ENST00000485019	CRYBA2	P53672	197 aa		11.48	□□□□□ -0.57

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