RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422939.1

TRPS1-204, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRPS1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-204ENST00000422939 FBXO32Q969P5 355 aa3.51□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 EBF4Q9BQW3 602 aa3.51□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 HCAR1Q9BXC0 346 aa3.51□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa3.51□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.51□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 APMAPQ9HDC9 416 aa3.51□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 STARD5Q9NSY2 213 aa3.51□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 RPH3ALQ9UNE2 315 aa3.51□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa3.51□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 SHANK3Q9BYB0 1731 aa3.5□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa3.5□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 TOPBP1Q92547 1522 aa3.5□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 GRIN2DO15399 1336 aa3.5□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 TEX14Q8IWB6 1497 aa3.5□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa3.5□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 CASKO14936 926 aa3.5□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 OR1F1O43749 312 aa3.5□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 ZNF861PO60384 105 aa3.5□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 TM7SF2O76062 418 aa3.5□□□□□ -1.85
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TRPS1-204ENST00000422939 PAX7P23759 505 aa3.5□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 ACTR3P61158 418 aa3.5□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 ZP4Q12836 540 aa3.5□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
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TRPS1-204ENST00000422939 ZYG11AQ6WRX3 759 aa3.5□□□□□ -1.85
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TRPS1-204ENST00000422939 ANKFN1Q8N957 763 aa3.5□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 NECAB1Q8N987 351 aa3.5□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 UPRTQ96BW1 309 aa3.5□□□□□ -1.85
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TRPS1-204ENST00000422939 TESK2Q96S53 571 aa3.5□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 SLC30A2Q9BRI3 323 aa3.5□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 DPH7Q9BTV6 452 aa3.5□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 EDEM2Q9BV94 578 aa3.5□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 CALHM2Q9HA72 323 aa3.5□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 ELOVL3Q9HB03 270 aa3.5□□□□□ -1.85
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TRPS1-204ENST00000422939 LRRK1Q38SD2 2015 aa3.49□□□□□ -1.85
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TRPS1-204ENST00000422939 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
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TRPS1-204ENST00000422939 TMEM17Q86X19 198 aa3.49□□□□□ -1.85
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TRPS1-204ENST00000422939 UNC79Q9P2D8 2635 aa3.48□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 PTPRKQ15262 1439 aa3.48□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa3.48□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 ARID1AO14497 2285 aa3.48□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 HELTA6NFD8 242 aa3.48□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 E9PBE3 544 aa3.48□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 C11orf98E9PRG8 122 aa3.48□□□□□ -1.85
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TRPS1-204ENST00000422939 ZSCAN12O43309 604 aa3.48□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 EMC8O43402 210 aa3.48□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 DUX1O43812 170 aa3.48□□□□□ -1.85
TRPS1-204ENST00000422939 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
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