RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 SDCCAG3Q96C92 435 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 ZFP3Q96NJ6 502 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 UCN2Q96RP3 112 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 TUBA1CQ9BQE3 449 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC13A4Q9UKG4 626 aa13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 CLCA1A8K7I4 914 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 SHISA8B8ZZ34 492 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 FXYD1O00168 92 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 FAAHO00519 579 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 PRKAR1BP31321 381 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 SESN3P58005 492 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 MERTKQ12866 999 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 SELENBP1Q13228 472 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 SGCBQ16585 318 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 RABL3Q5HYI8 236 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 ERICH5Q6P6B1 374 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF836Q6ZNA1 936 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 GRINAQ7Z429 371 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 P4HA3Q7Z4N8 544 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 PTOV1Q86YD1 416 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 C10orf111Q8N326 155 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 RPRMLQ8N4K4 120 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 POC1BQ8TC44 478 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC39A3Q9BRY0 314 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 EVA1AQ9H8M9 152 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 TIGARQ9NQ88 270 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 KLHL28Q9NXS3 571 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF6Q9Y252 685 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 CACNA1CQ13936 2221 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 MAST4O15021 2626 aa13.87□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 ADAMDEC1O15204 470 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 CLDN14O95500 239 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 NTN1O95631 604 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 IFNA14P01570 189 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 FCGR2AP12318 317 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 PCGF2P35227 344 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 IDH2P48735 452 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 CLDN15P56746 228 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 CLDN20P56880 219 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 SELPLGQ14242 412 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 VMACQ2NL98 169 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2A2Q6IF42 318 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 C3orf33Q6P1S2 294 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 HACD2Q6Y1H2 254 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 TREML1Q86YW5 311 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 ARMC8Q8IUR7 673 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 ZZZ3Q8IYH5 903 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 LILRB4Q8NHJ6 448 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 KLHL15Q96M94 604 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 KLHDC3Q9BQ90 382 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM8Q9BZR9 551 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 RLIMQ9NVW2 624 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF175Q9Y473 711 aa13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC22A20A6NK97 555 aa13.85□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 SYNGR4O95473 234 aa13.85□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 COL8A1P27658 744 aa13.85□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 AQP1P29972 269 aa13.85□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC7A1P30825 629 aa13.85□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC1A3P43003 542 aa13.85□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 NUDT2P50583 147 aa13.85□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 MNAT1P51948 309 aa13.85□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 MAP2K6P52564 334 aa13.85□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 DLX5P56178 289 aa13.85□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 CARD18P57730 90 aa13.85□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 EPS8Q12929 822 aa13.85□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa13.85□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 CLIP4Q8N3C7 705 aa13.85□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC197Q8NCU1 140 aa13.85□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa13.85□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2V1Q8NHB1 315 aa13.85□□□□□ -0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC26A7Q8TE54 656 aa13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms