RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 OR1E3Q8WZA6 343 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 DCUN1D4Q92564 292 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 TBC1D31Q96DN5 1066 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF799Q96GE5 643 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 EBF4Q9BQW3 602 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 MAGT1Q9H0U3 335 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF385DQ9H6B1 395 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 SH2D2AQ9NP31 389 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 HPF1Q9NWY4 346 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 AIPL1Q9NZN9 384 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 GNG12Q9UBI6 72 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 ALG6Q9Y672 507 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 ZSCAN12O43309 604 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 SMPD2O60906 423 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 TM7SF2O76062 418 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 IGHDP01880 384 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 CCNE1P24864 410 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 CD1BP29016 333 aa2.54□□□□□ -2
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RABGGTB-202ENST00000370826 AP3M2P53677 418 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 APOC4P55056 127 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 CHRNB3Q05901 458 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC173Q0VFZ6 552 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 ARCQ7LC44 396 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 TPRA1Q86W33 373 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 OR5L2Q8NGL0 311 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 RAET1EQ8TD07 263 aa2.54□□□□□ -2
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RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM101Q96IK0 257 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC35E1Q96K37 410 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF285Q96NJ3 590 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM117Q9H0C3 514 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 NARFLQ9H6Q4 476 aa2.54□□□□□ -2
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RABGGTB-202ENST00000370826 CHRNA9Q9UGM1 479 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 TMCC3Q9ULS5 477 aa2.54□□□□□ -2
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RABGGTB-202ENST00000370826 CDH10Q9Y6N8 788 aa2.54□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa2.53□□□□□ -2
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RABGGTB-202ENST00000370826 E7ESA3 106 aa2.53□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 PPIAL4DF5H284 164 aa2.53□□□□□ -2
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RABGGTB-202ENST00000370826 PRKXP51817 358 aa2.53□□□□□ -2
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RABGGTB-202ENST00000370826 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 USH1GQ495M9 461 aa2.53□□□□□ -2
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RABGGTB-202ENST00000370826 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa2.53□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa2.53□□□□□ -2
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RABGGTB-202ENST00000370826 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa2.53□□□□□ -2
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RABGGTB-202ENST00000370826 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa2.53□□□□□ -2
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RABGGTB-202ENST00000370826 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 LAMP5Q9UJQ1 280 aa2.53□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa2.53□□□□□ -2
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RABGGTB-202ENST00000370826 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa2.53□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1B0GWJ7 208 aa2.52□□□□□ -2.01
RABGGTB-202ENST00000370826 PSMB11A5LHX3 300 aa2.52□□□□□ -2.01
RABGGTB-202ENST00000370826 NPIPA7E9PJI5 369 aa2.52□□□□□ -2.01
RABGGTB-202ENST00000370826 RS1O15537 224 aa2.52□□□□□ -2.01
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