RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 HDAC8Q9BY41 377 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 SLC25A18Q9H1K4 315 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 CACNG2Q9Y698 323 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 FUOMA2VDF0 154 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF264O43296 627 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 AQP9O43315 295 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 GPRIN2O60269 458 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 OR1D4P47884 311 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 ITFG2Q969R8 447 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 IL1AP01583 271 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 ARSBP15848 533 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 VASPP50552 380 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 TAS2R31P59538 309 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 FAM69AQ5T7M9 428 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 VN1R2Q8NFZ6 395 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 PBDC1Q9BVG4 233 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 MS4A8Q9BY19 250 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 NUMBLQ9Y6R0 609 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 PAHP00439 452 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 GM2AP17900 193 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 NPR2P20594 1047 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 SGPP2Q8IWX5 399 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 OR14A16Q8NHC5 309 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 CER1O95813 267 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 FURINP09958 794 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 LINC01465Q8N7H1 131 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 AGBL5Q8NDL9 886 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 C16orf58Q96GQ5 468 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 HCAR1Q9BXC0 346 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 POLHQ9Y253 713 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 IGHG1P01857 330 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 S100PP25815 95 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 MSX1P28360 303 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 ARG2P78540 354 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 GPR18Q14330 331 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 MMP21Q8N119 569 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 MED17Q9NVC6 651 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 RASD1Q9Y272 281 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 C5P01031 1676 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0A6YYH2 397 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 A6NJ64 397 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 HOXA9P31269 272 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 ERV3-1Q14264 604 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 MTFR2Q6P444 385 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF767PQ75MW2 155 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF740Q8NDX6 193 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 OR51Q1Q8NH59 317 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 C17orf50Q8WW18 174 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 SLC6A20Q9NP91 592 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 SCGB2A1O75556 95 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 TUBG1P23258 451 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 GCH1P30793 250 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 OR2T11Q8NH01 316 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 RAB9BQ9NP90 201 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 CDC14CA4D256 554 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 PDE7AQ13946 482 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 SPPL3Q8TCT6 385 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 SLC2A12Q8TD20 617 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 ASB17Q8WXJ9 295 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 J3KTA2 159 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 SLCO2B1O94956 709 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 AKAIN1P0CW23 69 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 FGFBP1Q14512 234 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 TMEFF1Q8IYR6 380 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 ZFP90Q8TF47 636 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 GLYATL2Q8WU03 294 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 CLDN24A6NM45 220 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 REEP5Q00765 189 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 LEXMQ3ZCV2 418 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 SLC35F3Q8IY50 421 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 ISL2Q96A47 359 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 SGCZQ96LD1 299 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 CEPT1Q9Y6K0 416 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 YY2O15391 372 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 FXYD4P59646 89 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms