RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029180.13

Rprd1b-201, Transcript of Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rprd1b, Length 4,283 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Acy1Q99JW2 408 aa8.4□□□□□ -1.06
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 EtfaQ99LC5 333 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 GmfbQ9CQI3 142 aa8.4□□□□□ -1.06
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gkn2Q9CQS6 184 aa8.4□□□□□ -1.06
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dsn1Q9CYC5 348 aa8.4□□□□□ -1.06
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 RhouQ9EQT3 261 aa8.4□□□□□ -1.06
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sphk2Q9JIA7 617 aa8.4□□□□□ -1.06
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gdf2Q9WV56 428 aa8.4□□□□□ -1.06
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Otud3B1AZ99 396 aa8.4□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zfp809G3X9G7 402 aa8.4□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vmn2r92L7N2A4 860 aa8.4□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Best1O88870 551 aa8.4□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lin7bO88951 207 aa8.4□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 P01670 111 aa8.4□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 P01671 111 aa8.4□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 P01672 111 aa8.4□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dnaaf3Q3UYV8 586 aa8.4□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 CfiQ61129 603 aa8.4□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr285Q7TS17 319 aa8.4□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Spag1Q80ZX8 901 aa8.4□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ppp1r1cQ8BKK4 108 aa8.4□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Adipor2Q8BQS5 386 aa8.4□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gpr153Q8K0Z9 631 aa8.4□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Grhl2Q8K5C0 625 aa8.4□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vmn1r230Q8R2A2 316 aa8.4□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vmn1r6Q8R2D4 303 aa8.4□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ubqln1Q8R317 582 aa8.4□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr183Q8VFB9 309 aa8.4□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr1217Q8VGG1 304 aa8.4□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Recql5Q8VID5 982 aa8.4□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Arv1Q9D0U9 266 aa8.4□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Klhdc8bQ9D2D9 354 aa8.4□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Asf1bQ9DAP7 202 aa8.4□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 MgamB5THE2 1827 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mcm3apQ9WUU9 1971 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PpigA2AR02 752 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr1153A2AVC0 318 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vmn2r108E9PYS0 855 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zfp949E9Q732 603 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 1700080E11RikE9Q9G1 206 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm1110F6Y113 635 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 FaslgP41047 279 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pxmp2P42925 194 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lim2P56563 173 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 VegfcP97953 415 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 SbplQ3TUY3 232 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Wdr20Q3UWE6 569 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hspb6Q5EBG6 162 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 ClpbQ60649 677 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dag1Q62165 893 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 JamlQ80UL9 379 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Agfg2Q80WC7 479 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zer1Q80ZJ6 779 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Creg2Q8BGC9 288 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Q9D112 206 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dhx34Q9DBV3 1145 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cdc40Q9DC48 579 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ascl3Q9JJR7 174 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 TescQ9JKL5 214 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 ProdhQ9WU79 599 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm28710A0A1B0GR31 962 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dgat2l6A2ADU8 337 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fam71f2B2RXB0 297 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr420E9Q4G0 321 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zfp938E9Q9G3 579 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm6882J3KMT3 313 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Adra2bP30545 450 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 EpxP49290 716 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cdkn2bP55271 130 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rps26P62855 115 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Otx2P80206 289 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 G6pdxQ00612 515 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nhlh1Q02576 133 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 ChatQ03059 641 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lgals3bpQ07797 577 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm10662Q3UT86 313 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fut10Q5F2L2 481 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Thoc6Q5U4D9 341 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Wipi2Q80W47 445 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gper1Q8BMP4 375 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 NdnfQ8C119 568 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Angptl8Q8R1L8 198 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pcdhga12Q91XY7 932 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmem159Q922Z1 161 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mto1Q923Z3 669 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dnttip1Q99LB0 328 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ppil1Q9D0W5 166 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Stx11Q9D3G5 287 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ppm1dQ9QZ67 598 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Shroom3Q9QXN0 1986 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 A0A286YDP4 300 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Wdr76A6PWY4 622 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ssxa1B1AUS7 101 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fam84bD3YXJ5 310 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 OpcmlG5E8G3 345 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 1700014D04RikJ3QMS2 983 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fabp9O08716 132 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Scarb2O35114 478 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Psmb5O55234 264 aa8.39□□□□□ -1.07
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zfp60P16374 707 aa8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.2 ms