Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQT3

Rhou, Rho-related GTP-binding protein RhoU, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhouQ9EQT3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RhouQ9EQT3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
RhouQ9EQT3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RhouQ9EQT3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RhouQ9EQT3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RhouQ9EQT3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RhouQ9EQT3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RhouQ9EQT3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RhouQ9EQT3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RhouQ9EQT3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RhouQ9EQT3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RhouQ9EQT3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RhouQ9EQT3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RhouQ9EQT3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RhouQ9EQT3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RhouQ9EQT3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RhouQ9EQT3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RhouQ9EQT3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RhouQ9EQT3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RhouQ9EQT3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RhouQ9EQT3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RhouQ9EQT3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RhouQ9EQT3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RhouQ9EQT3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RhouQ9EQT3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RhouQ9EQT3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RhouQ9EQT3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RhouQ9EQT3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RhouQ9EQT3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RhouQ9EQT3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RhouQ9EQT3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RhouQ9EQT3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RhouQ9EQT3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RhouQ9EQT3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RhouQ9EQT3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RhouQ9EQT3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RhouQ9EQT3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RhouQ9EQT3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RhouQ9EQT3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RhouQ9EQT3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RhouQ9EQT3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RhouQ9EQT3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RhouQ9EQT3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RhouQ9EQT3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RhouQ9EQT3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RhouQ9EQT3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RhouQ9EQT3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RhouQ9EQT3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RhouQ9EQT3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RhouQ9EQT3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RhouQ9EQT3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RhouQ9EQT3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RhouQ9EQT3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RhouQ9EQT3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RhouQ9EQT3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RhouQ9EQT3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RhouQ9EQT3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RhouQ9EQT3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RhouQ9EQT3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RhouQ9EQT3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RhouQ9EQT3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RhouQ9EQT3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RhouQ9EQT3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RhouQ9EQT3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RhouQ9EQT3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RhouQ9EQT3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RhouQ9EQT3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RhouQ9EQT3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RhouQ9EQT3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RhouQ9EQT3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RhouQ9EQT3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RhouQ9EQT3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RhouQ9EQT3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RhouQ9EQT3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RhouQ9EQT3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RhouQ9EQT3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RhouQ9EQT3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RhouQ9EQT3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RhouQ9EQT3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RhouQ9EQT3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RhouQ9EQT3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RhouQ9EQT3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RhouQ9EQT3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RhouQ9EQT3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RhouQ9EQT3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RhouQ9EQT3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RhouQ9EQT3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RhouQ9EQT3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RhouQ9EQT3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RhouQ9EQT3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RhouQ9EQT3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RhouQ9EQT3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RhouQ9EQT3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RhouQ9EQT3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RhouQ9EQT3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RhouQ9EQT3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RhouQ9EQT3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RhouQ9EQT3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RhouQ9EQT3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RhouQ9EQT3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms