Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQT3

Rhou, Rho-related GTP-binding protein RhoU, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhouQ9EQT3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
RhouQ9EQT3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,11■■■□□ 2,41
RhouQ9EQT3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,26
RhouQ9EQT3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
RhouQ9EQT3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
RhouQ9EQT3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
RhouQ9EQT3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
RhouQ9EQT3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
RhouQ9EQT3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
RhouQ9EQT3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
RhouQ9EQT3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
RhouQ9EQT3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
RhouQ9EQT3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
RhouQ9EQT3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
RhouQ9EQT3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
RhouQ9EQT3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,93■■□□□ 1,9
RhouQ9EQT3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
RhouQ9EQT3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
RhouQ9EQT3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
RhouQ9EQT3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
RhouQ9EQT3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,43■■□□□ 1,82
RhouQ9EQT3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,42■■□□□ 1,82
RhouQ9EQT3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,39■■□□□ 1,82
RhouQ9EQT3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
RhouQ9EQT3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,79
RhouQ9EQT3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
RhouQ9EQT3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
RhouQ9EQT3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
RhouQ9EQT3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,73
RhouQ9EQT3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,82■■□□□ 1,72
RhouQ9EQT3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
RhouQ9EQT3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,74■■□□□ 1,71
RhouQ9EQT3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
RhouQ9EQT3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,65■■□□□ 1,7
RhouQ9EQT3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
RhouQ9EQT3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,62■■□□□ 1,69
RhouQ9EQT3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,62■■□□□ 1,69
RhouQ9EQT3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
RhouQ9EQT3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
RhouQ9EQT3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
RhouQ9EQT3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25,53■■□□□ 1,68
RhouQ9EQT3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
RhouQ9EQT3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,52■■□□□ 1,68
RhouQ9EQT3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
RhouQ9EQT3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
RhouQ9EQT3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
RhouQ9EQT3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
RhouQ9EQT3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
RhouQ9EQT3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
RhouQ9EQT3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
RhouQ9EQT3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
RhouQ9EQT3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
RhouQ9EQT3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25,29■■□□□ 1,64
RhouQ9EQT3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
RhouQ9EQT3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,25■■□□□ 1,63
RhouQ9EQT3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
RhouQ9EQT3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
RhouQ9EQT3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
RhouQ9EQT3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25,13■■□□□ 1,61
RhouQ9EQT3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
RhouQ9EQT3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
RhouQ9EQT3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
RhouQ9EQT3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
RhouQ9EQT3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
RhouQ9EQT3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
RhouQ9EQT3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,77■■□□□ 1,56
RhouQ9EQT3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
RhouQ9EQT3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,73■■□□□ 1,55
RhouQ9EQT3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
RhouQ9EQT3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,7■■□□□ 1,54
RhouQ9EQT3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,7■■□□□ 1,54
RhouQ9EQT3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
RhouQ9EQT3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
RhouQ9EQT3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
RhouQ9EQT3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
RhouQ9EQT3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,61■■□□□ 1,53
RhouQ9EQT3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
RhouQ9EQT3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
RhouQ9EQT3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
RhouQ9EQT3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,48■■□□□ 1,51
RhouQ9EQT3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
RhouQ9EQT3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
RhouQ9EQT3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
RhouQ9EQT3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,41■■□□□ 1,5
RhouQ9EQT3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,35■■□□□ 1,49
RhouQ9EQT3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
RhouQ9EQT3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
RhouQ9EQT3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,29■■□□□ 1,48
RhouQ9EQT3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
RhouQ9EQT3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
RhouQ9EQT3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
RhouQ9EQT3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
RhouQ9EQT3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
RhouQ9EQT3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
RhouQ9EQT3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
RhouQ9EQT3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
RhouQ9EQT3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
RhouQ9EQT3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
RhouQ9EQT3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
RhouQ9EQT3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,01■■□□□ 1,43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms