RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638481.1

SPIN3-208, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,050 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-208	ENST00000638481	DDOST	P39656	456 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	FOXL2	P58012	376 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	MED25	Q71SY5	747 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	NAXD	Q8IW45	347 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	ASB15	Q8WXK1	588 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	CMAHP	Q9Y471	501 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481		V9GYH0	126 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	DUXA	A6NLW8	204 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	SCO2	O43819	266 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	IFNA16	P05015	189 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	PGD	P52209	483 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	PSPH	P78330	225 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	TCF15	Q12870	199 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	COX10	Q12887	443 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	DOC2B	Q14184	412 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	RAB43	Q86YS6	212 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	BBS10	Q8TAM1	723 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	GPR151	Q8TDV0	419 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	FCMR	O60667	390 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	TPST2	O60704	377 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	RAB36	O95755	333 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	CHRNE	Q04844	493 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	SERTAD2	Q14140	314 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	GNA13	Q14344	377 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	CCDC157	Q569K6	752 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	COMTD1	Q86VU5	262 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	BMPER	Q8N8U9	685 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	FUZ	Q9BT04	418 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	PIGU	Q9H490	435 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	LIPT1	Q9Y234	373 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481		A0A0G2JPF8	293 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	IRGM	A1A4Y4	181 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF292	O60281	2723 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	IL1A	P01583	271 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	CCL4	P13236	92 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	MAP3K8	P41279	467 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	EMD	P50402	254 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	ZG16B	Q96DA0	208 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	SRR	Q9GZT4	340 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	KNTC1	P50748	2209 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481		A0A1W2PRQ8	180 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	C17orf105	B2RV13	164 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	LGI1	O95970	557 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	AGR2	O95994	175 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	HBQ1	P09105	142 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	FGF5	P12034	268 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	SCN1B	Q07699	218 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-208	ENST00000638481	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		13.78	□□□□□ -0.2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms