RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613424.4

IRF1-211, Transcript of interferon regulatory factor 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene IRF1, Length 821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1-211ENST00000613424 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 ARL8BQ9NVJ2 186 aa15.01□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 ANGPT4Q9Y264 503 aa15.01□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 CDHR4A6H8M9 788 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 WIPF3A6NGB9 483 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 H3BML4 177 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 NDUFAB1O14561 156 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 ADAM11O75078 769 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 LDLRP01130 860 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 ZNF708P17019 499 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 ADH6P28332 368 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 AQP1P29972 269 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 CPA2P48052 419 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 CLDN18P56856 261 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 FOXF1Q12946 379 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 ZSWIM7Q19AV6 140 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 VMACQ2NL98 169 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 SLC25A53Q5H9E4 307 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 C1orf185Q5T7R7 199 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 RNF220Q5VTB9 566 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 KRT73Q86Y46 540 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 SLC15A3Q8IY34 581 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 CCDC120Q96HB5 630 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 ZNF607Q96SK3 696 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 CMTM6Q9NX76 183 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 TAGLN3Q9UI15 199 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 USP22Q9UPT9 525 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 FAM215AQ9Y5M1 114 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 AP4B1Q9Y6B7 739 aa15□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 CCT8L1PA6NM43 557 aa14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 M0QX08 132 aa14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 AP3D1O14617 1153 aa14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 EFNA2O43921 213 aa14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 GKN3PP0CG01 181 aa14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 RNF224P0DH78 156 aa14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 IL11P20809 199 aa14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 PCGF2P35227 344 aa14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 PTGER4P35408 488 aa14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 SLC6A8P48029 635 aa14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 PER3P56645 1201 aa14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 CLDN15P56746 228 aa14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 SESN3P58005 492 aa14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 ADORA2A-AS1P86434 159 aa14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 TMEM211Q6ICI0 200 aa14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 RPTNQ6XPR3 784 aa14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 ARPINQ7Z6K5 226 aa14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 SLC30A8Q8IWU4 369 aa14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 UBQLNLQ8IYU4 475 aa14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 MARVELD2Q8N4S9 558 aa14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 ZNF563Q8TA94 476 aa14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 ZPLD1Q8TCW7 415 aa14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 ST8SIA1Q92185 356 aa14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 MRGPRX4Q96LA9 322 aa14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 ARMC7Q9H6L4 198 aa14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 AP3M1Q9Y2T2 418 aa14.99□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 CFAP73A6NFT4 308 aa14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 H0Y3Z8 333 aa14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 H0YC42 278 aa14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 TPST1O60507 370 aa14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 ZG16O60844 167 aa14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 SERPINB7O75635 380 aa14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 MFN2O95140 757 aa14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 NTN1O95631 604 aa14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 EPPINO95925 133 aa14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 OPN1LWP04000 364 aa14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 PRKAR1BP31321 381 aa14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 IDH2P48735 452 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 CLDN20P56880 219 aa14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 PSME3P61289 254 aa14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 RAC1P63000 192 aa14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 DMTNQ08495 405 aa14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 PMPCAQ10713 525 aa14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 EPS8Q12929 822 aa14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 KRT72Q14CN4 511 aa14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 30.2
IRF1-211ENST00000613424 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 MTFR2Q6P444 385 aa14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 ARMC8Q8IUR7 673 aa14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 ZNF440Q8IYI8 595 aa14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 MEIOBQ8N635 442 aa14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 SSC4DQ8WTU2 575 aa14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
IRF1-211ENST00000613424 TMEM234Q8WY98 164 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms