RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612121.4

LTBP4-233, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 3

Gene LTBP4, Length 755 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-233	ENST00000612121	CAV1	Q03135	178 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	HSPB3	Q12988	150 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	DUSP5	Q16690	384 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	FBXO30	Q8TB52	745 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	TIMM22	Q9Y584	194 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	CIB4	A0PJX0	185 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	ZSCAN12	O43309	604 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	VENTX	O95231	258 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	NUDT14	O95848	222 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	IGHV3-9	P01782	118 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	SLC7A1	P30825	629 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	P2RX1	P51575	399 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	PRKAG1	P54619	331 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	PHC1	P78364	1004 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	SELENBP1	Q13228	472 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	GPR119	Q8TDV5	335 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	MUS81	Q96NY9	551 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	KCNA7	Q96RP8	456 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	TRMO	Q9BU70	441 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	FKRP	Q9H9S5	495 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	LRP5L	A4QPB2	252 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	GPC1	P35052	558 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	SERPINB4	P48594	390 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	GABRA6	Q16445	453 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	CARTPT	Q16568	116 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	WDR31	Q8NA23	367 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	NUP43	Q8NFH3	380 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	FBXO17	Q96EF6	278 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	H6PD	O95479	791 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	NTF4	P34130	210 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	KLHL26	Q53HC5	615 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	COX18	Q8N8Q8	333 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	EGLN2	Q96KS0	407 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	TMEM237	Q96Q45	408 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	ASB6	Q9NWX5	421 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121		A0A0A6YYJ9	748 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	PDPK1	O15530	556 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	HSPA4L	O95757	839 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	ITGA5	P08648	1049 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	ALOX5	P09917	674 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	IL2RG	P31785	369 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	PDK3	Q15120	406 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	TEX35	Q5T0J7	233 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	SZRD1	Q7Z422	152 aa		13.54	□□□□□ -0.24
LTBP4-233	ENST00000612121	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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