RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 BMP4P12644 408 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 RPS15P62841 145 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 ATG4BQ9Y4P1 393 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 H3BUI4 141 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 TIMP2P16035 220 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 ADRA1AP35348 466 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 GLO1Q04760 184 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 OR7A5Q15622 319 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 SLC14A2Q15849 920 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 WASH6PQ9NQA3 447 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 VDAC3Q9Y277 283 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 C1orf105O95561 183 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 TNFSF8P32971 234 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 CDK3Q00526 305 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa20.02■□□□□ 0.8
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PTPRM-211ENST00000580170 V9GY05 133 aa20.02■□□□□ 0.8
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PTPRM-211ENST00000580170 GM2AP17900 193 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 SLC5A2P31639 672 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
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PTPRM-211ENST00000580170 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
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PTPRM-211ENST00000580170 EGLN2Q96KS0 407 aa20.02■□□□□ 0.79
PTPRM-211ENST00000580170 NTN4Q9HB63 628 aa20.02■□□□□ 0.79
PTPRM-211ENST00000580170 SCML1Q9UN30 329 aa20.02■□□□□ 0.79
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PTPRM-211ENST00000580170 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa20.01■□□□□ 0.79
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PTPRM-211ENST00000580170 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
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PTPRM-211ENST00000580170 Q6ZSR6 202 aa20■□□□□ 0.79
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PTPRM-211ENST00000580170 ASB11Q8WXH4 323 aa20■□□□□ 0.79
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PTPRM-211ENST00000580170 INPP5EQ9NRR6 644 aa20■□□□□ 0.79
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PTPRM-211ENST00000580170 DSC1Q08554 894 aa20■□□□□ 0.79
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