RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 THBS4P35443 961 aa8.8□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EIF1P41567 113 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ELK3P41970 407 aa8.8□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAC3P60763 192 aa8.8□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRPS1P60891 318 aa8.8□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LMO4P61968 165 aa8.8□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM189A2Q15884 450 aa8.8□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIKESHIQ53FT3 197 aa8.8□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GALNT18Q6P9A2 607 aa8.8□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLHL24Q6TFL4 600 aa8.8□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM107Q6UX40 140 aa8.8□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GAS2L3Q86XJ1 694 aa8.8□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.8□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDK20Q8IZL9 346 aa8.8□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 METTL4Q8N3J2 472 aa8.8□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC16A11Q8NCK7 471 aa8.8□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa8.8□□□□□ -1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACTRT2Q8TDY3 377 aa8.8□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRPC4APQ8TEL6 797 aa8.8□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAIP1Q8WWC4 291 aa8.8□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.8□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ERP27Q96DN0 273 aa8.8□□□□□ -1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5B2Q96R09 309 aa8.8□□□□□ -1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.8□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IPPKQ9H8X2 491 aa8.8□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POPDC3Q9HBV1 291 aa8.8□□□□□ -1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ALG1L2C9J202 215 aa8.79□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TIMM23O14925 209 aa8.79□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COQ9O75208 318 aa8.79□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNH1O95259 989 aa8.79□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSPAN15O95858 294 aa8.79□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WNT11O96014 354 aa8.79□□□□□ -1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPR2P20594 1047 aa8.79□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CXCR5P32302 372 aa8.79□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GTF2H2Q13888 395 aa8.79□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 JADE3Q92613 823 aa8.79□□□□□ -1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UPB1Q9UBR1 384 aa8.79□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF69Q9UC07 566 aa8.79□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WNK2Q9Y3S1 2297 aa8.79□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C3orf80F5H4A9 247 aa8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HPXP02790 462 aa8.78□□□□□ -1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MPIP34949 423 aa8.78□□□□□ -1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFT88Q13099 833 aa8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC9A3R2Q15599 337 aa8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRADDQ15628 312 aa8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD226Q15762 336 aa8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PFKFB4Q16877 469 aa8.78□□□□□ -1
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AVPI1Q5T686 147 aa8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FRG2Q64ET8 278 aa8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASPHD2Q6ICH7 369 aa8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZAR1Q86SH2 424 aa8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ISCA2Q86U28 154 aa8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF214Q8ND24 703 aa8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FBXO30Q8TB52 745 aa8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR151Q8TDV0 419 aa8.78□□□□□ -1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBTD2Q8WUN7 234 aa8.78□□□□□ -1
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