RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498530.5

PMPCB-208, Transcript of peptidase, mitochondrial processing beta subunit, human

TSL 2

Gene PMPCB, Length 1,161 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMPCB-208	ENST00000498530	SYK	P43405	635 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	TPMT	P51580	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	SPAG1	Q07617	926 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	CALCOCO2	Q13137	446 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	TMED1	Q13445	227 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	CYP51A1	Q16850	503 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	TP53I3	Q53FA7	332 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	RAET1L	Q5VY80	246 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	REP15	Q6BDI9	236 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	TMEM107	Q6UX40	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	PRSS33	Q8NF86	280 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	RAB3C	Q96E17	227 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	CFAP53	Q96M91	514 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	AMBN	Q9NP70	447 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	USP16	Q9Y5T5	823 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	CD109	Q6YHK3	1445 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	PP2D1	A8MPX8	630 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	HAS3	O00219	553 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	RNF13	O43567	381 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	HP	P00738	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	CST1	P01037	141 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	IGLV1-44	P01699	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	PVR	P15151	417 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	MAP3K8	P41279	467 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	PEX6	Q13608	980 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	IL18	Q14116	193 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	NECTIN1	Q15223	517 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	PPP1R7	Q15435	360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	VWA2	Q5GFL6	755 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	ERICH1	Q86X53	443 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	STARD8	Q92502	1023 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	PEX13	Q92968	403 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	RHBG	Q9H310	441 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	FANCE	Q9HB96	536 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	POLE4	Q9NR33	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	NUDT15	Q9NV35	164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	CPQ	Q9Y646	472 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	AUP1	Q9Y679	476 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PMPCB-208	ENST00000498530	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	OR2AG2	A6NM03	316 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	RS1	O15537	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	UGT2B17	O75795	530 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	DIRAS1	O95057	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	MCF2	P10911	925 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	GYG1	P46976	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	ENPEP	Q07075	957 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	GK3P	Q14409	553 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	TPRA1	Q86W33	373 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	RFESD	Q8TAC1	157 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	TMEM80	Q96HE8	168 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PMPCB-208	ENST00000498530	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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