RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 IL1BP01584 269 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 CAPN1P07384 714 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 CYP2B6P20813 491 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 ADORA2BP29275 332 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 TDO2P48775 406 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 LIM2P55344 173 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 FILIP1LQ4L180 1135 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 CDC20BQ86Y33 519 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 OR5L2Q8NGL0 311 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 ARNTL2Q8WYA1 636 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 SLC35A5Q9BS91 424 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 SMOXQ9NWM0 555 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 RIMS3Q9UJD0 308 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 CDH9Q9ULB4 789 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-212ENST00000491302 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 K7ENP7 123 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 STSP08842 583 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 MMP11P24347 488 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 IL2RGP31785 369 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 SSR1P43307 286 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP10-9P60411 292 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 DPYSL2Q16555 572 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 MAIP1Q8WWC4 291 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 LRRN3Q9H3W5 708 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 GLIPR2Q9H4G4 154 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 RAB18Q9NP72 206 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 IL36GQ9NZH8 169 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 LRP5LA4QPB2 252 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 FRG2CA6NGY1 282 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 LATO43561 262 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 TSC22D2O75157 780 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 ALOX5P09917 674 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 GDF1P27539 372 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 GSG1Q2KHT4 349 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A52Q3SY17 297 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 TP53I3Q53FA7 332 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 PAGE2BQ5JRK9 111 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 CGB2Q6NT52 195 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 GPR65Q8IYL9 337 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 OR13C2Q8NGS9 318 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 CYP2S1Q96SQ9 504 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 NPAS2Q99743 824 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 RHBGQ9H310 441 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 IKZF5Q9H5V7 419 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 ASB3Q9Y575 518 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM64CA6NLI5 447 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 SULT2B1O00204 365 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 THY1P04216 161 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC130P13994 396 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 RPS2P15880 293 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 EPHX2P34913 555 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 MDH2P40926 338 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 STARP49675 285 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 TNFRSF17Q02223 184 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 SLC10A7Q0GE19 358 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC74AQ0VAA2 488 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 DNM1P46Q6ZS02 220 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 GPR137CQ8N3F9 429 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 GTSF1Q8WW33 167 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 PAXXQ9BUH6 204 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 FN3KRPQ9HA64 309 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 F5H6K3 240 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 PRKYO43930 277 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 HCN1O60741 890 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 B4GALT2O60909 372 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 SNX4O95219 450 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 PRKAR2BP31323 418 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 UGT1A3P35503 534 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 GCKP35557 465 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 KIR2DS2P43631 304 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 CCT3P49368 545 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 PRKXP51817 358 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 EFNB2P52799 333 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 KLRC3Q07444 240 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf61Q13536 156 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 SLC1A5Q15758 541 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 OR5D13Q8NGL4 314 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRC-212ENST00000491302 OR2A12Q8NGT7 310 aa5.8□□□□□ -1.48
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