RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 TAS2R10Q9NYW0 307 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC167Q9P0B6 97 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa10.63□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 TCRBV5S2A0A599 114 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 PRAMEF25A6NGN4 478 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 LRRC14BA6NHZ5 514 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 H0YIV9 168 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 MSTNO14793 375 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 CLOCKO15516 846 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 CBR3O75828 277 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 SULT1C4O75897 302 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 CPMP14384 443 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 PCSK2P16519 638 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 NAGAP17050 411 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 S1PR1P21453 382 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC6A2P23975 617 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 CHMP24386 653 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 MC3RP41968 323 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 PIK3CGP48736 1102 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 LHX2P50458 406 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 GFRA1P56159 465 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 PLCXD2Q0VAA5 305 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 RAB39AQ14964 217 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 CYBRD1Q53TN4 286 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 LIPJQ5W064 366 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 KANK2Q63ZY3 851 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 VWA1Q6PCB0 445 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM111BQ6SJ93 734 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 SCIMPQ6UWF3 145 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 P4HA3Q7Z4N8 544 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF786Q8N393 782 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 GIPC3Q8TF64 312 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 CTHRC1Q96CG8 243 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 REPS1Q96D71 796 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 SFXN2Q96NB2 322 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 HS3ST6Q96QI5 342 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 BRINP2Q9C0B6 783 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 AP3M1Q9Y2T2 418 aa10.62□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 A0A1W2PP18 115 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 ANGPT2O15123 496 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 UGT2B11O75310 529 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 ATP6V1G1O75348 118 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 SERPINB7O75635 380 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 TIPRLO75663 272 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 LBPP18428 481 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 CCNA2P20248 432 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 CRYGSP22914 178 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 CD79BP40259 229 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 BCAP31P51572 246 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 CLDN18P56856 261 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 SNTA1Q13424 505 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM81Q6P7N7 255 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 C20orf204Q6ZNR8 217 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF550Q7Z398 422 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 DPP10Q8N608 796 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM156AQ8NDB6 213 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 LRRC58Q96CX6 371 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 STARD4Q96DR4 205 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 OSBPL10Q9BXB5 764 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 ERGIC3Q9Y282 383 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 CUBNO60494 3623 aa10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP10.61□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 FUOMA2VDF0 154 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 SAC3D1A6NKF1 404 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM233B4DJY2 109 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 ARPC2O15144 300 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 KLK1P06870 262 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 ALOX5P09917 674 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 MTHFD2P13995 350 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF708P17019 499 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 SRD5A2P31213 254 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 CCKARP32238 428 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 PTH2RP49190 550 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 SIRPAP78324 504 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 PFKFB4Q16877 469 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 TTC23Q5W5X9 447 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 OR5M10Q6IEU7 315 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 RNF165Q6ZSG1 346 aa10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms