RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422770.5

HERC3-204, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-204ENST00000422770 STAMBPO95630 424 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 CSTAP01040 98 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 OPN1LWP04000 364 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 BCHEP06276 602 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 NUDT7P0C024 238 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
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HERC3-204ENST00000422770 NCK1P16333 377 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 ATP6V1B2P21281 511 aa8.75□□□□□ -1.01
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HERC3-204ENST00000422770 CHMP24386 653 aa8.75□□□□□ -1.01
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HERC3-204ENST00000422770 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 ERFP50548 548 aa8.75□□□□□ -1.01
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HERC3-204ENST00000422770 CDSNQ15517 529 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 SYPL1Q16563 259 aa8.75□□□□□ -1.01
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HERC3-204ENST00000422770 C1orf146Q5VVC0 180 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 ZNF787Q6DD87 383 aa8.75□□□□□ -1.01
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HERC3-204ENST00000422770 PLXDC2Q6UX71 529 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa8.75□□□□□ -1.01
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HERC3-204ENST00000422770 ZZZ3Q8IYH5 903 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 MICU2Q8IYU8 434 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 ZNF619Q8N2I2 560 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 ANKFN1Q8N957 763 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 TNIP2Q8NFZ5 429 aa8.75□□□□□ -1.01
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HERC3-204ENST00000422770 MIPOL1Q8TD10 442 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 NTNG2Q96CW9 530 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 ARSGQ96EG1 525 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 RNF145Q96MT1 663 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 TUBA1CQ9BQE3 449 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 UCK2Q9BZX2 261 aa8.75□□□□□ -1.01
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HERC3-204ENST00000422770 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 ZNF350Q9GZX5 532 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
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HERC3-204ENST00000422770 KCNJ16Q9NPI9 418 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 STOML1Q9UBI4 398 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 P2RX2Q9UBL9 471 aa8.75□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 Q9UFV3 132 aa8.75□□□□□ -1.01
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HERC3-204ENST00000422770 ZNF337Q9Y3M9 751 aa8.75□□□□□ -1.01
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HERC3-204ENST00000422770 COL12A1Q99715 3063 aa8.74□□□□□ -1.01
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HERC3-204ENST00000422770 C5orf58C9J3I9 102 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 H0YHG0 523 aa8.74□□□□□ -1.01
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HERC3-204ENST00000422770 ZNF264O43296 627 aa8.74□□□□□ -1.01
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HERC3-204ENST00000422770 COX6B1P14854 86 aa8.74□□□□□ -1.01
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HERC3-204ENST00000422770 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 CBLN3Q6UW01 205 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 FRRS1Q6ZNA5 592 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
HERC3-204ENST00000422770 C11orf65Q8NCR3 313 aa8.74□□□□□ -1.01
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