RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 SGCDQ92629 289 aa5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 SLC38A4Q969I6 547 aa5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 UBE2FQ969M7 185 aa5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 TMIGD2Q96BF3 282 aa5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 SLC41A3Q96GZ6 507 aa5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 ART5Q96L15 291 aa5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 LRFN5Q96NI6 719 aa5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 DOK1Q99704 481 aa5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 GPA33Q99795 319 aa5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF426Q9BUY5 554 aa5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 CNPPD1Q9BV87 410 aa5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 ITPAQ9BY32 194 aa5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 SEMA4CQ9C0C4 833 aa5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 HOXD1Q9GZZ0 328 aa5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 ARMC7Q9H6L4 198 aa5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 SLC25A19Q9HC21 320 aa5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 Q9N2J8 555 aa5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 SLC13A4Q9UKG4 626 aa5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 RARRES3Q9UL19 164 aa5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 CBLCQ9ULV8 474 aa5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 TPRKBQ9Y3C4 175 aa5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 RP1P56715 2156 aa5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 SPTBP11277 2137 aa5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 SDK1Q7Z5N4 2213 aa5.54□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 A0A0B4J2E0 115 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 A0A1B0GX12 115 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 EFCAB7A8K855 629 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 NPIPA7E9PJI5 369 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 H3BSA7 217 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 XPNPEP2O43895 674 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 IGF2P01344 180 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 ZGLP1P0C6A0 271 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 NPIPA8P0DM63 369 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 POU2F1P14859 743 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 TNNI3P19429 210 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 DCKP27707 260 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 FMO3P31513 532 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 CCKBRP32239 447 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 STAT5AP42229 794 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 GRK6P43250 576 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 GIPRP48546 466 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 PGDP52209 483 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 CTBP2P56545 445 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 CDC42P60953 191 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 DCDP81605 110 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 HOXC5Q00444 222 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 IL1RL1Q01638 556 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 MC2RQ01718 297 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 PMS2P3Q13401 168 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 IRF3Q14653 427 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 RAB39AQ14964 217 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 EBPQ15125 230 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 OR1Q1Q15612 314 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 CNPY1Q3B7I2 92 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 VWA2Q5GFL6 755 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 PDZK1Q5T2W1 519 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 RNLSQ5VYX0 342 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM205Q6UW68 189 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 WDR88Q6ZMY6 472 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 KCTD8Q6ZWB6 473 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 PRSS48Q7RTY5 328 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 SLCO6A1Q86UG4 719 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 KIF18BQ86Y91 864 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 NKAIN4Q8IVV8 208 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF440Q8IYI8 595 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 NLGN4XQ8N0W4 816 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 FAM26EQ8N5C1 309 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF321PQ8N8H1 164 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 OR13F1Q8NGS4 319 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 STT3BQ8TCJ2 826 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 RNF138Q8WVD3 245 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 MUL1Q969V5 352 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 HS6ST2Q96MM7 605 aa5.53□□□□□ -1.52
C6orf48-208ENST00000395788 OR6C1Q96RD1 312 aa5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms