RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Il1rl1P14719 567 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CpoxP36552 443 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 InmtP40936 264 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ackr3P56485 362 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cxcr4P70658 359 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RptnP97347 1118 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ces2fQ08ED5 561 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Asphd1Q2TA57 360 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Alg6Q3TAE8 507 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pin1rt1Q3ULQ2 159 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kcnh1Q60603 989 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ddx5Q61656 614 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ProcrQ64695 242 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp975Q6NVD6 525 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GfralQ6SJE0 393 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tas2r131Q7M708 310 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr128Q7TRJ1 308 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zar1Q80SU3 361 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc36a3Q811P0 477 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nabp1Q8BGW5 198 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rgs8Q8BXT1 180 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Krt222Q8CCX5 294 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Alkbh3Q8K1E6 286 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc31a1Q8K211 196 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr341Q8VGK9 313 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1413Q8VGU3 323 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrg1Q91XL1 342 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrgpra5Q91ZC7 304 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tekt2Q922G7 430 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 EsamQ925F2 394 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Psip1Q99JF8 528 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sucnr1Q99MT6 317 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trim8Q99PJ2 551 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Utp23Q9CX11 249 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam162bQ9CX19 157 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cep83Q9D5R3 692 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Echdc3Q9D7J9 300 aa10.09□□□□□ -0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fbn1Q61554 2873 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp462B1AWL2 2495 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 6430628N08RikA0A0U1RQ45 177 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 L3mbtl1A2A5N8 826 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r2A2AMT6 306 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Esp18A8R0V1 91 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp964B2RR88 472 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pdzd8B9EJ80 1147 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mn1D3YWE6 1297 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm45711E0CXA2 391 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prr36E9PV26 1098 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4933402N22RikF7D1B3 190 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm2035J3QP87 144 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc1a6O35544 561 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vti1bO88384 232 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01746 140 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ctf2P83714 204 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Emx2Q04744 253 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sox13Q04891 613 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Treml2Q2LA85 329 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q32M26 199 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 LipnQ3U4B4 400 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Smu1Q3UKJ7 513 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 C130050O18RikQ497Y9 356 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Otub1Q7TQI3 271 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gramd1bQ80TI0 738 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Poldip3Q8BG81 420 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tacstd2Q8BGV3 317 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zpld1Q8BGZ8 415 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnf38Q8BI21 518 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zcchc3Q8BPK2 400 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ZxdcQ8C8V1 858 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stx5Q8K1E0 355 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sf3b4Q8QZY9 424 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r84Q8R284 318 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mgat5Q8R4G6 740 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gys2Q8VCB3 704 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr291Q8VF60 317 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cers2Q924Z4 380 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem216Q9CQC4 141 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Popdc3Q9ES81 291 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Clca3a1Q9QX15 902 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lhx2Q9Z0S2 406 aa10.08□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 1700028J19RikA0A0U1RP08 172 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1555-ps1A0A140LHT7 321 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm20721E9Q2U8 318 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm21820J3KMU2 361 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm4141K9J7H2 306 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Clk3O35492 638 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Il6P08505 211 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nid1P10493 1245 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GhrP16882 650 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 LhcgrP30730 700 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TstP52196 297 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kcnk2P97438 426 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem120bQ3TA38 339 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc37a3Q3TIT8 494 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr332Q5NC45 344 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc30a1Q60738 503 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rpa2Q62193 270 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stx3Q64704 289 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ssxb5Q6XAS2 159 aa10.07□□□□□ -0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cpeb4Q7TN98 729 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 83.5 ms