Protein–RNA interactions for Protein: E9PV26

Prr36, Proline-rich 36, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr36E9PV26 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,73■■■□□ 2,99
Prr36E9PV26 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Prr36E9PV26 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Prr36E9PV26 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,54
Prr36E9PV26 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Prr36E9PV26 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Prr36E9PV26 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,93■■■□□ 2,38
Prr36E9PV26 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,74■■■□□ 2,35
Prr36E9PV26 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Prr36E9PV26 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,42■■■□□ 2,3
Prr36E9PV26 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,13■■■□□ 2,25
Prr36E9PV26 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Prr36E9PV26 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,94■■■□□ 2,22
Prr36E9PV26 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Prr36E9PV26 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Prr36E9PV26 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,2
Prr36E9PV26 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Prr36E9PV26 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Prr36E9PV26 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Prr36E9PV26 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Prr36E9PV26 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Prr36E9PV26 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Prr36E9PV26 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Prr36E9PV26 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Prr36E9PV26 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Prr36E9PV26 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Prr36E9PV26 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Prr36E9PV26 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,14■■■□□ 2,1
Prr36E9PV26 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,11■■■□□ 2,09
Prr36E9PV26 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Prr36E9PV26 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Prr36E9PV26 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Prr36E9PV26 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Prr36E9PV26 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Prr36E9PV26 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Prr36E9PV26 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Prr36E9PV26 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Prr36E9PV26 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Prr36E9PV26 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Prr36E9PV26 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,5■■□□□ 1,99
Prr36E9PV26 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,45■■□□□ 1,98
Prr36E9PV26 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Prr36E9PV26 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Prr36E9PV26 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Prr36E9PV26 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Prr36E9PV26 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Prr36E9PV26 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Prr36E9PV26 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,07■■□□□ 1,92
Prr36E9PV26 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Prr36E9PV26 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1,91
Prr36E9PV26 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Prr36E9PV26 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Prr36E9PV26 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Prr36E9PV26 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Prr36E9PV26 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Prr36E9PV26 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Prr36E9PV26 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Prr36E9PV26 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Prr36E9PV26 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Prr36E9PV26 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Prr36E9PV26 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Prr36E9PV26 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Prr36E9PV26 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Prr36E9PV26 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,56■■□□□ 1,84
Prr36E9PV26 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Prr36E9PV26 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Prr36E9PV26 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,52■■□□□ 1,84
Prr36E9PV26 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,51■■□□□ 1,83
Prr36E9PV26 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Prr36E9PV26 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Prr36E9PV26 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Prr36E9PV26 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Prr36E9PV26 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Prr36E9PV26 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Prr36E9PV26 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Prr36E9PV26 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,31■■□□□ 1,8
Prr36E9PV26 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Prr36E9PV26 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Prr36E9PV26 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Prr36E9PV26 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Prr36E9PV26 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Prr36E9PV26 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Prr36E9PV26 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Prr36E9PV26 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Prr36E9PV26 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Prr36E9PV26 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Prr36E9PV26 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,01■■□□□ 1,75
Prr36E9PV26 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Prr36E9PV26 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Prr36E9PV26 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Prr36E9PV26 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Prr36E9PV26 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Prr36E9PV26 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,72
Prr36E9PV26 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Prr36E9PV26 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Prr36E9PV26 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Prr36E9PV26 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Prr36E9PV26 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Prr36E9PV26 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Prr36E9PV26 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,7 ms