RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 ZP2Q05996 745 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 TSPAN31Q12999 210 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM163Q8TC26 289 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 NEDD4LQ96PU5 975 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 ATE1O95260 518 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 PKLRP30613 574 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 GXYLT1Q4G148 440 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 GALNT6Q8NCL4 622 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC6A18Q96N87 628 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 PKMYT1Q99640 499 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 OPN1LWP04000 364 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 GRK5P34947 590 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 RAB11BQ15907 218 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC6A7Q99884 636 aa19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 KRBA1A5PL33 1030 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 S100A9P06702 114 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 DPTQ07507 201 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 GPR19Q15760 415 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 WBP2NLQ6ICG8 309 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 DLEU7Q6UYE1 221 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 EID2Q8N6I1 236 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 POGLUT1Q8NBL1 392 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 LMF1Q96S06 567 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 MYADMQ96S97 322 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 ASIC5Q9NY37 505 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 SIT1Q9Y3P8 196 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 SULT2B1O00204 365 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 SELENOVP59797 346 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 CDNFQ49AH0 187 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC48A1Q6P1K1 146 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 SYNPOQ8N3V7 929 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 OR4F15Q8NGB8 312 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC37A2Q8TED4 501 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 PPT2Q9UMR5 302 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 RNF215Q9Y6U7 377 aa19.33■□□□□ 0.69
PTPRJ-208ENST00000615445 BLACEA4D250 179 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 FZD6O60353 706 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 RAD51DO75771 328 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 CFL1P23528 166 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 PSMB10P40306 273 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 AKR1D1P51857 326 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 CHRFAM7AQ494W8 412 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 INIPQ9NRY2 104 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 TBC1D29Q9UFV1 150 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 RBMXP38159 391 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF81P51508 661 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 FGF21Q9NSA1 209 aa19.33■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 TBPL2Q6SJ96 375 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 C1GALT1Q9NS00 363 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 RLIMQ9NVW2 624 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 CACNA1CQ13936 2221 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 CENPBD1B2RD01 187 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 CD3GP09693 182 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 ARRB2P32121 409 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 CAPZA1P52907 286 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 OLIG3Q7RTU3 272 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 MGAT4AQ9UM21 535 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 COL4A1P02462 1669 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 GJE1A6NN92 205 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 SYT7O43581 403 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 ZFAND5O76080 213 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 H2AFB2P0C5Z0 115 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC6A12P48065 614 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 MAN2A2P49641 1150 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 OR13C2Q8NGS9 318 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 GPR148Q8TDV2 347 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 MNTQ99583 582 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF337Q9Y3M9 751 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 TOXO94900 526 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF28P17035 718 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 CD40LGP29965 261 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 PYCR3Q53H96 274 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 GDPD1Q8N9F7 314 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 A6NIZ1 184 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF195O14628 629 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 PEX11BO96011 259 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 RAP1BP61224 184 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 RAP1AP62834 184 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRJ-208ENST00000615445 PDE7AQ13946 482 aa19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms