RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556321.1

PSMA3-210, Transcript of proteasome subunit alpha 3, human

TSL 2

Gene PSMA3, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA3-210	ENST00000556321	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	THEG	Q9P2T0	379 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321		H0Y8G0	127 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	ARPC3	O15145	178 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	B4GALT2	O60909	372 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	PGK1	P00558	417 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	ANOS1	P23352	680 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	CHRNB4	P30926	498 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	RAG2	P55895	527 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	OSTN	P61366	133 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	GNB1	P62873	340 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	CUL2	Q13617	745 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	CD226	Q15762	336 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	FAM189A2	Q15884	450 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	HLA-B	Q31612	363 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	LUZP1	Q86V48	1076 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	SYT14	Q8NB59	555 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	FAM3C	Q92520	227 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	COQ2	Q96H96	371 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	DHRS7	Q9Y394	339 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	PTPRS	Q13332	1948 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321		A0A0J9YVX5	310 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	MEIOC	A2RUB1	952 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	BTN3A3	O00478	584 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	PRRG1	O14668	218 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	TM9SF1	O15321	606 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	CABYR	O75952	493 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	CLDN1	O95832	211 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	TPSB2	P20231	275 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	TBXA2R	P21731	343 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	UCP1	P25874	307 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	SAA4	P35542	130 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	MMP12	P39900	470 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF85	Q03923	595 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	EMC2	Q15006	297 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	TPSAB1	Q15661	275 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	SYPL1	Q16563	259 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	PNCK	Q6P2M8	343 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	BIRC7	Q96CA5	298 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	RCHY1	Q96PM5	261 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	F2RL3	Q96RI0	385 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSMA3-210	ENST00000556321	NT5DC2	Q9H857	520 aa		4.13	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms