RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	DEFA6	Q01524	100 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF117	Q03924	483 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	C2orf80	Q0P641	193 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	FBXO30	Q8TB52	745 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	GPR151	Q8TDV0	419 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	GIMAP5	Q96F15	307 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	DPH5	Q9H2P9	285 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC189	A1A4V9	331 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	CYTIP	O60759	359 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	KCNK2	O95069	426 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	NPIPA8	P0DM63	369 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	HSD17B3	P37058	310 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	RAC3	P60763	192 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	CHRNB3	Q05901	458 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	BTK	Q06187	659 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	GABRA6	Q16445	453 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	PRR31	Q5SQ13	230 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	RINL	Q6ZS11	566 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	SLC43A2	Q8N370	569 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	ZFP90	Q8TF47	636 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	MUS81	Q96NY9	551 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	VPS11	Q9H270	941 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	NTM	Q9P121	344 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	METRN	Q9UJH8	293 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	SNX6	Q9UNH7	406 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF724	A8MTY0	619 aa		10.6	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	10.6	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	KCNH1	O95259	989 aa		10.6	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	STAMBP	O95630	424 aa		10.6	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	OTC	P00480	354 aa		10.6	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	ITGA5	P08648	1049 aa		10.6	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	TACSTD2	P09758	323 aa		10.6	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	PRKCA	P17252	672 aa		10.6	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	PHC1	P78364	1004 aa		10.6	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	GUCY2D	Q02846	1103 aa		10.6	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	TRIP10	Q15642	601 aa		10.6	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	DUSP5	Q16690	384 aa		10.6	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		10.6	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	GPR119	Q8TDV5	335 aa		10.6	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		10.6	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	MYNN	Q9NPC7	610 aa		10.6	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		10.6	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		10.6	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	MOK	Q9UQ07	419 aa		10.6	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	CIB4	A0PJX0	185 aa		10.59	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	SERINC4	A6NH21	518 aa		10.59	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		10.59	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557		A8MT66	165 aa		10.59	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	ESPN	B1AK53	854 aa		10.59	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	PDLIM1	O00151	329 aa		10.59	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	TMPRSS2	O15393	492 aa		10.59	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	GSTA2	P09210	222 aa		10.59	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	ELK4	P28324	431 aa		10.59	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	TYK2	P29597	1187 aa		10.59	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	CDH15	P55291	814 aa		10.59	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	ACTG1	P63261	375 aa		10.59	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	LGALS3BP	Q08380	585 aa		10.59	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		10.59	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	UNC50	Q53HI1	259 aa		10.59	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	10.59	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		10.59	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		10.59	□□□□□ -0.71
BBS1-222	ENST00000533557	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		10.59	□□□□□ -0.71

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