RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 RBP1P09455 135 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 RHOXF2BP0C7M4 288 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 NR1D1P20393 614 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 CHMP24386 653 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 MCM3P25205 808 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 DCTP40126 519 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 GRIA1P42261 906 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 MSH2P43246 934 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 UQCRFS1P47985 274 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 RAP1GDS1P52306 607 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 MLF1P58340 268 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 RAB10P61026 200 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 CCZ1BP86790 482 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
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HDAC2-216ENST00000523628 OLIG2Q13516 323 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 CUL3Q13618 768 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 TGFBIQ15582 683 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 PPP1R3AQ16821 1122 aa3.85□□□□□ -1.79
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HDAC2-216ENST00000523628 SFT2D3Q587I9 215 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 C6orf10Q5SRN2 563 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 WLSQ5T9L3 541 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 MED27Q6P2C8 311 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 IL20RBQ6UXL0 311 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 CYHR1Q6ZMK1 362 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 LINC00696Q6ZRV3 163 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 CAMKMTQ7Z624 323 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 PXKQ7Z7A4 578 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 TMPRSS11BQ86T26 416 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 GPAT4Q86UL3 456 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
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HDAC2-216ENST00000523628 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
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HDAC2-216ENST00000523628 UBTD2Q8WUN7 234 aa3.85□□□□□ -1.79
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HDAC2-216ENST00000523628 NEIL2Q969S2 332 aa3.85□□□□□ -1.79
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HDAC2-216ENST00000523628 IL17FQ96PD4 163 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 GPR22Q99680 433 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 LRRC1Q9BTT6 524 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 IFT27Q9BW83 186 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
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HDAC2-216ENST00000523628 C10orf88Q9H8K7 445 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
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HDAC2-216ENST00000523628 TAS2R10Q9NYW0 307 aa3.85□□□□□ -1.79
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HDAC2-216ENST00000523628 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 MAU2Q9Y6X3 613 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 DOCK10Q96BY6 2186 aa3.85□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 TACC2O95359 2948 aa3.84□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 DPPA5A6NC42 116 aa3.84□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 LRIT2A6NDA9 550 aa3.84□□□□□ -1.79
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HDAC2-216ENST00000523628 HSPB2A8KAH6 182 aa3.84□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 H0YIV9 168 aa3.84□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 K7EPI3 171 aa3.84□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 TSPAN4O14817 238 aa3.84□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 ACOX3O15254 700 aa3.84□□□□□ -1.79
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HDAC2-216ENST00000523628 CHST10O43529 356 aa3.84□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 KERAO60938 352 aa3.84□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 HSPA4LO95757 839 aa3.84□□□□□ -1.79
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HDAC2-216ENST00000523628 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa3.84□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 SPTBP11277 2137 aa3.84□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 CDH1P12830 882 aa3.84□□□□□ -1.79
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HDAC2-216ENST00000523628 IL1RNP18510 177 aa3.84□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 CNR1P21554 472 aa3.84□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 PSMB5P28074 263 aa3.84□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 HTR1EP28566 365 aa3.84□□□□□ -1.79
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HDAC2-216ENST00000523628 DCTDP32321 178 aa3.84□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 CA5AP35218 305 aa3.84□□□□□ -1.79
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HDAC2-216ENST00000523628 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 GNG11P61952 73 aa3.84□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 CRADDP78560 199 aa3.84□□□□□ -1.79
HDAC2-216ENST00000523628 SORDQ00796 357 aa3.84□□□□□ -1.79
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