RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 CKAP2Q8WWK9 683 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 HOXD1Q9GZZ0 328 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 RUBCNLQ9H714 662 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 JKAMPQ9P055 326 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 AP4B1Q9Y6B7 739 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 OTOGQ6ZRI0 2925 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PNV4 684 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 SERINC4A6NH21 518 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 CLDN24A6NM45 220 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 RFXANKO14593 260 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 TNFSF11O14788 317 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 EFNA2O43921 213 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 AQP8O94778 261 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 H6PDO95479 791 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 IL6P05231 212 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC6A8P48029 635 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 MAPK11Q15759 364 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP4R4Q6NUP7 873 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC2A7Q6PXP3 512 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 P4HA3Q7Z4N8 544 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 LUZP2Q86TE4 346 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR119Q8TDV5 335 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 ZFP90Q8TF47 636 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 ZG16BQ96DA0 208 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 C14orf79Q96F83 325 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 LURAP1Q96LR2 239 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 SFXN3Q9BWM7 321 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 EXD2Q9NVH0 621 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR45Q9Y484 360 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 FREM1Q5H8C1 2179 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC01387J3KSC0 135 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF264O43296 627 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 PRKCAP17252 672 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 SFTPDP35247 375 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 OPRM1P35372 400 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 SIRPAP78324 504 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 CHRNEQ04844 493 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 MYBPHQ13203 477 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 FGFBP1Q14512 234 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 GPAT3Q53EU6 434 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 ATAD3BQ5T9A4 648 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 ZZZ3Q8IYH5 903 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF619Q8N2I2 560 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIML2Q8N7C3 387 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM71CQ8NEG0 241 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 OR10D3Q8NH80 312 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXO27Q8NI29 283 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 MAGEB18Q96M61 343 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 ZFP3Q96NJ6 502 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A0J9YW62 118 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM234BA2RU67 622 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 H3BNH8 94 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 ADAM11O75078 769 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 CYP7B1O75881 506 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 SOX30O94993 753 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 NTN1O95631 604 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 IL18BPO95998 194 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 SSTR2P30874 369 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 QPRTQ15274 297 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 CHMP1BQ7LBR1 199 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 FUNDC1Q8IVP5 155 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 SAP130Q9H0E3 1048 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC38A1Q9H2H9 487 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 COQ10BQ9H8M1 238 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF122Q9H9V4 155 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 GALNT8Q9NY28 637 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 CRIM1Q9NZV1 1036 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 MYO9AB2RTY4 2548 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 SYT5O00445 386 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 NR5A2O00482 541 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 CXCL13O43927 109 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 TGDSO95455 350 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 AGR2O95994 175 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 CSTAP01040 98 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 ETFAP13804 333 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 CAPN3P20807 821 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 ELK4P28324 431 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 CPOXP36551 454 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 PGM1P36871 562 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 HPCAP84074 193 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 GUSBP1Q15486 140 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 C6orf10Q5SRN2 563 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 OR5W2Q8NH69 310 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL15Q96M94 604 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC28BQ9BUN5 200 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 SRXN1Q9BYN0 137 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
SH3BP2-218ENST00000511185 PACSIN3Q9UKS6 424 aa16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms