RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MED18Q9BUE0 208 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NUF2Q9BZD4 464 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MEAF6Q9HAF1 191 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ABCA4P78363 2273 aa13.57□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF195O14628 629 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TNFSF11O14788 317 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANKRD28O15084 1053 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF264O43296 627 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SCN2BO60939 215 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OPN1LWP04000 364 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GUSBP08236 651 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC18A1P54219 525 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RIPPLY3P57055 190 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RPS26P62854 115 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BST1Q10588 318 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF141Q15928 474 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATAD3BQ5T9A4 648 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AP1ARQ63HQ0 302 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF614Q8N883 585 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR5D16Q8NGK9 328 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR5W2Q8NH69 310 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARSGQ96EG1 525 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC35G5Q96KT7 338 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM185BQ9H7F4 350 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 POLE3Q9NRF9 147 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PNPOQ9NVS9 261 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 THAP1Q9NVV9 213 aa13.56□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SERINC4A6NH21 518 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRPC5OSA6NMA1 111 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NPIPA7E9PJI5 369 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATE1O95260 518 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NPIPA8P0DM63 369 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UBL4AP11441 157 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPP3CBP16298 524 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 S100A3P33764 101 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LRRC74AQ0VAA2 488 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FOXF1Q12946 379 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CBFBQ13951 182 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CASP8Q14790 479 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPR68Q15743 365 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC25A53Q5H9E4 307 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C16orf62Q7Z3J2 963 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPATA19Q7Z5L4 167 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STK32CQ86UX6 486 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANKRD42Q8N9B4 389 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FBXO27Q8NI29 283 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KLHDC3Q9BQ90 382 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LAT2Q9GZY6 243 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SERHL2Q9H4I8 314 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GP6Q9HCN6 339 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KLHL28Q9NXS3 571 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ITPR3Q14573 2671 aa13.55□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM120BA0PK00 339 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 E9PBE3 544 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLCO1B7G3V0H7 640 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HDAC3O15379 428 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OIP5O43482 229 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EFNA2O43921 213 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FCMRO60667 390 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ERLIN1O75477 346 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NTN1O95631 604 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CD99P14209 185 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRKCAP17252 672 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CRYGSP22914 178 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SFTPDP35247 375 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPP2R2AP63151 447 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PHC1P78364 1004 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 POU4F3Q15319 338 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DEFB113Q30KQ7 82 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPANXN4Q5MJ08 99 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PDZK1Q5T2W1 519 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATG16L1Q676U5 607 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BEND4Q6ZU67 534 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANKRD46Q86W74 232 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLEC4FQ8N1N0 589 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 XAGE5Q8WWM1 108 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NEURL3Q96EH8 262 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF350Q9GZX5 532 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR51I1Q9H343 314 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BTNL2Q9UIR0 455 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MED13LQ71F56 2210 aa13.54□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DNAJA2O60884 412 aa13.53□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CSTAP01040 98 aa13.53□□□□□ -0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms